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272401213

木虫 (正式写手)

引用回帖:
10楼: Originally posted by mahoumeimei at 2012-09-19 21:59:39
就是序列比对后,如果有一两个碱基是不一样的,那么它们也会被认为是相同序列吗?...

如果1、2个碱基不同,那么它们肯定就不是“相同”序列啦!如果它们不同的碱基是第三个密码子,那么它们翻译出来的蛋白是相同,而且也有可能有多种剪切方式,功能也不一样!你所说的“相同”,还是得看你是干什么用吧?
YNWA
11楼2012-09-20 09:01:13
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mahoumeimei

金虫 (小有名气)

引用回帖:
11楼: Originally posted by 272401213 at 2012-09-20 09:01:13
如果1、2个碱基不同,那么它们肯定就不是“相同”序列啦!如果它们不同的碱基是第三个密码子,那么它们翻译出来的蛋白是相同,而且也有可能有多种剪切方式,功能也不一样!你所说的“相同”,还是得看你是干什么用 ...

我做的是16s克隆,为了做菌群分析的。序列间差别几个碱基对我的blast结果其实并没有什么影响。所以不知道这样的算不算相同序列。
12楼2012-09-20 19:45:09
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272401213

木虫 (正式写手)

我觉得描述的话这样比较好,A与B的相似度有百分之几!仅供参考
YNWA
13楼2012-09-21 08:45:20
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