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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 序列筛选
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272401213

木虫 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by mahoumeimei at 2012-09-19 21:59:39
就是序列比对后，如果有一两个碱基是不一样的，那么它们也会被认为是相同序列吗？...

如果1、2个碱基不同，那么它们肯定就不是“相同”序列啦！如果它们不同的碱基是第三个密码子，那么它们翻译出来的蛋白是相同，而且也有可能有多种剪切方式，功能也不一样！你所说的“相同”，还是得看你是干什么用吧？
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YNWA
11楼2012-09-20 09:01:13
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mahoumeimei

金虫 (小有名气)
引用回帖:
11楼: Originally posted by 272401213 at 2012-09-20 09:01:13
如果1、2个碱基不同，那么它们肯定就不是“相同”序列啦！如果它们不同的碱基是第三个密码子，那么它们翻译出来的蛋白是相同，而且也有可能有多种剪切方式，功能也不一样！你所说的“相同”，还是得看你是干什么用 ...

我做的是16s克隆，为了做菌群分析的。序列间差别几个碱基对我的blast结果其实并没有什么影响。所以不知道这样的算不算相同序列。
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12楼2012-09-20 19:45:09
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272401213

木虫 (正式写手)
我觉得描述的话这样比较好，A与B的相似度有百分之几！仅供参考
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YNWA
13楼2012-09-21 08:45:20
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