24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 3985  |  回复: 12

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

你既然都下载了lammps,为何又没有安装软件呢?
安装的方法,你google一下,能找出一大堆
11楼2012-09-15 14:56:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

blueybz

木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-09-14 15:32:53
可以,比如我建立的双链dna分子模型:ploy(A-T)20.psf 和 ploy(A-T)20.pdb
先导入的VMD中:
mol load psf ploy(A-T)20.psf pdb ploy(A-T)20.pdb
然后直接输出成lammps 的data文件:
topo writelammpsdat ...

谢谢版主分享。有个问题,我刚才在vmd中输入命令,得到的结果和版主一样。要是用鼠标选择加载文件,得到的data原子类型是40,不知道什么原因?另外,为什么要加载2个文件呢?pdb是什么用处?刚学习,请多指教
12楼2012-10-16 12:24:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

烟雨胧人

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by Tanya_snail at 2012-09-13 09:48:13
data文件有两种格式,一种是二进制文件,一种是ascii文件,一般来说,我们可以看到的都属于ascii文件。ascii文件由两部分组成,一是文件头,二是原子信息。文件头包括一些说明的内容,还有原子数、键类型数、盒子的 ...

请问怎么将dump文件转化为data文件呢  急求 非常感谢
13楼2013-12-30 00:26:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xx4751 的主题更新
信息提示
请填处理意见