6楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-09-14 15:32:53
可以，比如我建立的双链dna分子模型：ploy(A-T)20.psf 和 ploy(A-T)20.pdb
先导入的VMD中：
mol load psf ploy(A-T)20.psf pdb ploy(A-T)20.pdb
然后直接输出成lammps 的data文件：
topo writelammpsdat ...

4楼: Originally posted by Tanya_snail at 2012-09-13 09:48:13
data文件有两种格式，一种是二进制文件，一种是ascii文件，一般来说，我们可以看到的都属于ascii文件。ascii文件由两部分组成，一是文件头，二是原子信息。文件头包括一些说明的内容，还有原子数、键类型数、盒子的 ...