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lammps read_data 文件格式
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11楼2012-09-15 14:56:00
lchchl
铜虫 (小有名气)
- 应助: 7 (幼儿园)
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- 散金: 128
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- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
2楼2012-09-12 19:03:41
xx47513楼2012-09-12 22:07:59
Tanya_snail
木虫 (小有名气)
- 应助: 25 (小学生)
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- 红花: 3
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- 注册: 2012-03-01
- 性别: MM
- 专业: 金属材料的微观结构
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+5, 赞！讲解的真细致！ 2012-09-13 09:53:11
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+5, 赞！讲解的真细致！ 2012-09-13 09:53:11
| data文件有两种格式，一种是二进制文件，一种是ascii文件，一般来说，我们可以看到的都属于ascii文件。ascii文件由两部分组成，一是文件头，二是原子信息。文件头包括一些说明的内容，还有原子数、键类型数、盒子的三维坐标上下界等一系列信息，原子信息部分就包括了每个原子的ID，三维坐标，类型等等信息，根据你选的atom_type不同，显示的内容也不一定相同。但至少都包括有原子ID以及坐标的信息。vmd中关于输出data文件的命令的完整格式为：topo writelammpsdata filename atom_type，在atom_type缺省的情况下默认为full。至于不同的atom_type有什么区别，参见lammps官方手册中atom_type的部分。这里要说明一点，lammps里面有一个命令叫write_restart，这个命令输出的data文件是二进制文件，所以我们使用文本编辑器打开之后看到的都是01这样的二进制数，可以使用一些小程序将二进制文件转换成文本文件（ascii文件），这些程序lammps工具包里有。 |
4楼2012-09-13 09:48:13