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剑雪封侯

新虫 (小有名气)

[求助] MS转化为lammps读入data文件的问题

你好,我在MS里面建个模型,石墨上面有根碳管,利用msi2lmp转化为lammps的data数据,要不要删除除了atom坐标信息以外的数据啊?
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jiaoyixiong

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs: 金币+6, 谢谢 2012-09-12 22:01:07
剑雪封侯: 金币+2, ★★★很有帮助, 嗯,能加下你的QQ么?方便以后交流 2012-09-13 09:34:18
1、这个lammps的tools里面也有说明吧?
2、这个转换过程也不是很耗时吧,为何不试一下?
3、转换过程中需要添加力场信息,你把别的都删掉了,你转换成lammps的data数据之后,你如何保证石墨和碳管的形状?即bond 和angle信息?
4、这个模型比较简单,推荐你使用VMD 建立石墨和碳管模型,你模拟中估计还需要加入水之类的吧?用vmd更方便,建立好了模型之后,在vmd中输入命令:
topo writelammpsdata graphene.data

就可以把你建立的系统模型转换成文件名为graphene.data 的lammps的data文件。
2楼2012-09-12 21:47:32
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剑雪封侯

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-09-12 21:47:32
1、这个lammps的tools里面也有说明吧?
2、这个转换过程也不是很耗时吧,为何不试一下?
3、转换过程中需要添加力场信息,你把别的都删掉了,你转换成lammps的data数据之后,你如何保证石墨和碳管的形状?即bond  ...

能加下你的QQ么,方便以后交流
3楼2012-09-13 09:35:09
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