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淡蓝幽香

新虫 (初入文坛)

[求助] perl程序咨询,有关pedigree信息分析的。

各位乡亲父老,小女又来啦~~~~

这次的input是:
#Fid   Iid    Pid   Mid   Sex Stat    Geno
5      2908   0      0       1    3       A G T C G T
5      2108   6256 4532  2   1        G T C A T C
20    4556   2089 2935  1    2       T T G A C C
5      6256   2908 6266  1    1       A C C T T C
5      4561   1145 2108  2    1       C C T G A G
117   1123   0      2354  1    2       C C T G A C
基本上,从2908— 6256— 2108— 4561就是一个家族的四代人,这个就是我想找到的信息。 从这个联系来分析我的整个数据文件, 有多少个家庭里有四代人的信息, 有多少家族只有两代人的信息,诸如此类。

现在我有的程序,已经可以把每个相同家庭里的人,放在一个group里,接下来的分析,搞不懂了,特求助各位。

这里附上我的上半段程序:
CODE:
use warnings;
use strict;

open (FN, "file1") or die $!;
open(OUT,">file2")or die $!;


my %hash;

while (){
    chomp;
    if (/(\d+)\s([\d\w]+\s[\d\w]+\s[\d\w]+)/){
        
        push @{ $hash{$1} },$2;            ###This is to save multiple elements into a key.
        
       }

}

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淡蓝幽香

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by ch_sunshine at 2012-09-18 17:33:07
不知道  我是刚申的这个 。 希望能帮到你...

引用回帖:
8楼: Originally posted by 淡蓝幽香 at 2012-09-18 16:10:03
多谢,我去试一下
对了,请问怎么个你加分?...

不知道  我是刚申的这个 。 希望能帮到你



评分显示:
当前回帖不是应助回帖,您不能对此进行金币奖励哦

请问还有其他方法加金币么。。。。
10楼2012-09-19 15:18:01
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淡蓝幽香

新虫 (初入文坛)

等不到有缘人啊~~~
3楼2012-09-12 14:25:07
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ch_sunshine

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

若是单纯想看看2、4代家系的个数信息,倒是有其他方法能得到。(比如:2代家系有N个)
5楼2012-09-14 17:06:43
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淡蓝幽香

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by ch_sunshine at 2012-09-14 17:06:43
若是单纯想看看2、4代家系的个数信息,倒是有其他方法能得到。(比如:2代家系有N个)

比如呢?
6楼2012-09-14 19:46:55
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