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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 从PROCAR中提取态密度的shell代码
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redsnowolf

银虫 (小有名气)

[资源] 从PROCAR中提取态密度的shell代码

压缩包中getTdos.sh、getPdos.sh和getLdos.sh分别用来计算体系的total dos、partial dos和单个原子（可指定）的

态密度，后两个需要POSCAR文件。

输入：依次输入所要计算的能量范围、费米能级、采样点数、高斯展宽，getLdos.sh还需要指定原子（默认每个原子都

计算）。

本人用的是vasp 5.2，INCAR中设置了LSORBIT = .TRUE. 和 LORBIT = 11，所得文件格式如下

PROCAR file：
PROCAR lm decomposed
# of k-points: 2925         # of bands:  28         # of ions:   2

k-point    1 :    0.00000000 0.00000000 0.00000000     weight = 0.00006400

band   1 # energy  -13.01545745 # occ.  1.00000000

ion      s     py     pz     px    dxy    dyz    dz2    dxz    dx2    tot
  1  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000
  2  0.000  0.000  0.000  0.000  0.182  0.210  0.209  0.193  0.182  0.976
tot  0.000  0.000  0.000  0.000  0.182  0.210  0.209  0.193  0.183  0.976
  1  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000
  2  0.000  0.000  0.000  0.000  0.008  0.210  0.154 -0.016 -0.008  0.348
tot  0.000  0.000  0.000  0.000  0.008  0.210  0.154 -0.016 -0.008  0.348
  1  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000
  2  0.000  0.000  0.000  0.000  0.017  0.009  0.128  0.192 -0.017  0.329
tot  0.000  0.000  0.000  0.000  0.017  0.009  0.128  0.192 -0.017  0.329
  1  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000
  2  0.000  0.000  0.000  0.000  0.181 -0.006 -0.058  0.002  0.182  0.301
tot  0.000  0.000  0.000  0.000  0.181 -0.006 -0.058  0.002  0.182  0.301

band   2 # energy  -13.01542280 # occ.  1.00000000

ion      s     py     pz     px    dxy    dyz    dz2    dxz    dx2    tot
  1  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000
  2  0.000  0.000  0.000  0.000  0.208  0.180  0.182  0.197  0.209  0.976
tot  0.000  0.000  0.000  0.000  0.208  0.180  0.182  0.197  0.209  0.976
  1  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000
  2  0.000  0.000  0.000  0.000 -0.053  0.172  0.097  0.000  0.053  0.269
tot  0.000  0.000  0.000  0.000 -0.053  0.172  0.097  0.000  0.053  0.269
  1  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000
  2  0.000  0.000  0.000  0.000 -0.198 -0.008 -0.029  0.048  0.199  0.012
tot  0.000  0.000  0.000  0.000 -0.198 -0.008 -0.029  0.048  0.199  0.012
  1  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000
  2  0.000  0.000  0.000  0.000  0.034 -0.053  0.152 -0.191  0.035 -0.023
tot  0.000  0.000  0.000  0.000  0.034 -0.053  0.152 -0.191  0.035 -0.023

band   3 # energy  -13.01541343 # occ.  1.00000000
......

如果是几个PROCAR合并到一起的，需要把k-points那儿改成总的k点数。不知道为什么PROCAR中每个band下每个原子有4组值（对应代码里的flag）。。。

POSCAR file：
POSCAR第6行需要是每种原子的数目，有些第6行是原子种类名称第7行才是数目，这样把原子名称那行删了就行了。

图中是DOSCAR中的和从PROCAR中计算的total dos比较，高斯展宽gauss=0.1 eV。

PS. 之前找了个getdos.f的Fortran程序，结果悲剧的发现完全不能用，不得已自己写了，本人Linux盲，现学的shell，希望有高手可以改得更效高些～
dos.jpg

[ Last edited by redsnowolf on 2012-9-8 at 18:53 ]
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1楼2012-09-08 18:50:15
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回帖置顶 ( 共有4个 )

chenweiguang

金虫 (小有名气)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

这相当于自己又重新做了一遍DOS
不解的是DOSCAR里面不是已经有了吗？而且vasp提供了多种方法
我看到有些人使用PROCAR重新得到DOS，这样做的意义是什么呢
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3楼2012-09-09 09:32:36
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zhangfan2192

金虫 (著名写手)

★★★ 三星级,支持鼓励

我也想知道PROCAR得到的DOS跟DOSCAR里面有什么不同？
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4楼2012-09-09 10:49:50
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redsnowolf

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by chenweiguang at 2012-09-09 09:32:36
这相当于自己又重新做了一遍DOS
不解的是DOSCAR里面不是已经有了吗？而且vasp提供了多种方法
我看到有些人使用PROCAR重新得到DOS，这样做的意义是什么呢

算dos需要较高的k点密度，有时候体系大了计算资源又有限，不能一下子算出来，得把k点分开算，然后再通过procar得到态密度，我就遇到这种情况了。。。
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6楼2012-09-09 12:39:14
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redsnowolf

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhangfan2192 at 2012-09-09 10:49:50
我也想知道PROCAR得到的DOS跟DOSCAR里面有什么不同？

我觉着按理应该一样的，可整出来的结果曲线总是有些差别，费解中。。。
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7楼2012-09-09 12:48:26
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普通回帖

huangll99

木虫 (职业作家)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

多谢分享~~~~~~
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2楼2012-09-08 18:59:38
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hchuanqi

禁虫 (初入文坛)
本帖内容被屏蔽
5楼2012-09-09 11:49:27
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SeanMa2010

铜虫 (初入文坛)
多谢分享，其实自己琢磨代码更能提高技巧
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9楼2012-09-13 10:41:03
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欧阳平平

木虫 (正式写手)

★★★ 三星级,支持鼓励

占个座，以后可能会用到。
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12楼2013-05-03 15:18:03
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wangsu123

铁虫 (初入文坛)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

顶一下，感谢分享！还不错哦!
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23楼2015-08-05 17:25:38
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kingsix8楼
2012-09-11 21:42   回复  
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105135818710楼
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欧阳平平13楼
2013-05-04 10:05   回复  
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wangdading15楼
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