| 查看: 4850 | 回复: 42 | |||||
| 【奖励】 本帖被评价34次，作者redsnowolf增加金币 26.2 个 | |||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||||
[资源]
从PROCAR中提取态密度的shell代码
|
|||||
|
压缩包中getTdos.sh、getPdos.sh和getLdos.sh分别用来计算体系的total dos、partial dos和单个原子（可指定）的 态密度，后两个需要POSCAR文件。 输入：依次输入所要计算的能量范围、费米能级、采样点数、高斯展宽，getLdos.sh还需要指定原子（默认每个原子都 计算）。 本人用的是vasp 5.2，INCAR中设置了LSORBIT = .TRUE. 和 LORBIT = 11，所得文件格式如下 PROCAR file： PROCAR lm decomposed # of k-points: 2925 # of bands: 28 # of ions: 2 k-point 1 : 0.00000000 0.00000000 0.00000000 weight = 0.00006400 band 1 # energy -13.01545745 # occ. 1.00000000 ion s py pz px dxy dyz dz2 dxz dx2 tot 1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.182 0.210 0.209 0.193 0.182 0.976 tot 0.000 0.000 0.000 0.000 0.182 0.210 0.209 0.193 0.183 0.976 1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.210 0.154 -0.016 -0.008 0.348 tot 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.210 0.154 -0.016 -0.008 0.348 1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.017 0.009 0.128 0.192 -0.017 0.329 tot 0.000 0.000 0.000 0.000 0.017 0.009 0.128 0.192 -0.017 0.329 1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.181 -0.006 -0.058 0.002 0.182 0.301 tot 0.000 0.000 0.000 0.000 0.181 -0.006 -0.058 0.002 0.182 0.301 band 2 # energy -13.01542280 # occ. 1.00000000 ion s py pz px dxy dyz dz2 dxz dx2 tot 1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.208 0.180 0.182 0.197 0.209 0.976 tot 0.000 0.000 0.000 0.000 0.208 0.180 0.182 0.197 0.209 0.976 1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 2 0.000 0.000 0.000 0.000 -0.053 0.172 0.097 0.000 0.053 0.269 tot 0.000 0.000 0.000 0.000 -0.053 0.172 0.097 0.000 0.053 0.269 1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 2 0.000 0.000 0.000 0.000 -0.198 -0.008 -0.029 0.048 0.199 0.012 tot 0.000 0.000 0.000 0.000 -0.198 -0.008 -0.029 0.048 0.199 0.012 1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.034 -0.053 0.152 -0.191 0.035 -0.023 tot 0.000 0.000 0.000 0.000 0.034 -0.053 0.152 -0.191 0.035 -0.023 band 3 # energy -13.01541343 # occ. 1.00000000 ...... 如果是几个PROCAR合并到一起的，需要把k-points那儿改成总的k点数。不知道为什么PROCAR中每个band下每个原子有4组值（对应代码里的flag）。。。 POSCAR file： POSCAR第6行需要是每种原子的数目，有些第6行是原子种类名称第7行才是数目，这样把原子名称那行删了就行了。 图中是DOSCAR中的和从PROCAR中计算的total dos比较，高斯展宽gauss=0.1 eV。 PS. 之前找了个getdos.f的Fortran程序，结果悲剧的发现完全不能用，不得已自己写了，本人Linux盲，现学的shell，希望有高手可以改得更效高些～  dos.jpg [ Last edited by redsnowolf on 2012-9-8 at 18:53 ] |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : get_dos_from_procar_file.rar
2012-09-08 18:47:46, 4.81 K
» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 第一性原理相关文档 | @个人收集@ | 分子动力学 |
» 猜你喜欢
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有5人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急
已经有5人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有5人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有5人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有5人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有6人回复
-
延安大学回应“副教授留绝笔信”：确已离世，正核实举报内容
已经有5人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有23人回复
4楼2012-09-09 10:49:50
2楼2012-09-08 18:59:38
3楼2012-09-09 09:32:36
6楼2012-09-09 12:39:14
简单回复
kingsix8楼
2012-09-11 21:42
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
105135818710楼
2013-03-14 19:10
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
105135818711楼
2013-04-03 10:13
回复
顶一下，感谢分享！
欧阳平平13楼
2013-05-04 10:05
回复
顶一下，感谢分享！
2008089014楼
2014-04-09 17:55
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
