| 查看: 3366 | 回复: 8 | ||||
| 【奖励】 本帖被评价4次，作者lfcmike增加金币 2.8 个 | ||||
[资源]
autodocktools 在linux下安装
|
||||
|
MGLTools包含了 AutoDockTools (ADT)  AutoDockTools AutoDockTools is graphical front-end for setting up and running AutoDock - an automated docking software designed to predict how small molecules, such as substrates or drug candidates, bind to a receptor of known 3D structure. Python Molecular Viewer (PMV)  PMV PMV is a powerful molecular viewer that has a number of customizable features and comes with many pluggable commands ranging from displaying molecular surfaces to advanced volume rendering. Vision  [PMV] Vision is a visual-programming environment in which a user can interactively build networks describing novel combinations of computational methods, and yielding new visualizations of their data without actually writing code. 这三部分 。。 下面来说一下这软件的安装方法 。。我是在ubuntu 12 下测试安装 安装包下载： http://115.com/file/dp49c2wa 下载所有需要的安装包 第一步，安装环境，这软件需要python imaging library （PIL）环境 PIL 还需要安装 TKINTER JPEG ZLIB (PNG/ZIP) FREETYPE2 LITTLECMS 这里只需要安装 JPEG ZLIB (PNG/ZIP) FREETYPE2 安装方法 在terminal下输入命令 安装zlib shell: $ tar -xvzf zlib-1.2.5.tar.gz $ cd zlib-1.2.5 $ ./configure --prefix=/usr/local {自定义安装在 /usr/local 文件夹} $ make $ sudo make install 安装 png shell: $ tar -xvzf libpng-1.5.6.tar.gz $ cd libpng-1.5.6 $ ./configure --prefix=/usr/local {自定义安装在 /usr/local 文件夹} $ make $ sudo make install 安装freetype shell: $ tar -jxf freetype-2.4.7.tar.gz $ cd freetype-2.4.7/ $ ./configure --prefix=/usr/local {自定义安装在 /usr/local 文件夹} $ make $ make install 安装install jpeg shell: $ tar -xvzf jpegsrc.v8c.tar.gz $ cd jpeg-8c/ $ ./configure --prefix=/usr/local {自定义安装在 /usr/local 文件夹} $ make $ sudo make install 接下来安装PIL（Python Imaging Library ） $ tar -xvzf Imaging-1.1.7.tar.gz $ cd Imaging-1.1.7/ 在安装前测试一下 shell: $ python setup.py build_ext -i 回输出： PIL 1.1.7 SETUP SUMMARY ——————————————————————– version 1.1.7 platform linux2 2.7.1+ (r271:86832, Apr 11 2011, 18:13:53) [GCC 4.5.2] ——————————————————————– *** TKINTER support not available — JPEG support available ———————–> OK！ — ZLIB (PNG/ZIP) support available ———————–> OK！ — FREETYPE2 support available ———————–> OK！ *** LITTLECMS support not available ——————————————————————– 正式安装： shell: $ python setup.py build $ sudo python setup.py install 第一步就完成了。。 第二步，安装MGLTools 。 安装方法： 进入文件目录： shell： $ cd {MGLTools-Linux-x86_1.5.6cr3-Install文件地址} 1，给MGLTools-Linux-x86_1.5.6cr3-Install文件授权： shell： $ chmod +x MGLTools-Linux-x86_1.5.6cr3-Install 2，运行 MGLTools-Linux-x86_1.5.6cr3-Install文件 shell: $ sudo /MGLTools-Linux-x86_1.5.6cr3-Install文件地址/MGLTools-Linux-x86_1.5.6cr3-Install 3，按提示安装。。 4，安装后配置MGLTools 。 需要将 /home/lfcmike/MGLTools-1.5.6rc3/bin 添加到路径环境中。 shell： $ export PATH="/usr/local/MGLTools-1.5.6rc3/bin:"$PATH 或者是： $ alias pmv='/usr/local/MGLTools-1.5.6rc3/bin/pmv' $ alias adt='/usr/local/MGLTools-1.5.6rc3/bin/adt' $ alias vision='/usr/local/MGLTools-1.5.6rc3/bin/vision' $ alias pythonsh='/usr/local/MGLTools-1.5.6rc3/bin/pythonsh' 5， shell： $ /usr/local/MGLTools-1.5.6rc3/bin/python setup.py install 第二步完成。。 最后运行 MGLTools shell： $ adt 有关错误解决方法 ：MGLTools http://mgltools.scripps.edu/downloads/instructions/linux/ [ Last edited by lfcmike on 2012-9-8 at 12:56 ] |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 药物设计相关 | 分子对接 |
» 猜你喜欢
焦虑
已经有8人回复
-
308求调剂
已经有4人回复
-
NSFC申报书里申请人简历中代表性论著还需要在申报书最后的附件里面再上传一遍吗
已经有14人回复
-
材料与化工一志愿南昌大学327求调剂推荐
已经有6人回复
-
化学调剂0703
已经有7人回复
-
327求调剂
已经有11人回复
-
调剂
已经有8人回复
-
梁成伟老师课题组欢迎你的加入
已经有7人回复
-
伙伴们，祝我生日快乐吧
已经有24人回复
-
中科院材料273求调剂
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 求win64位的mgltools安装文件
已经有7人回复
- linux下安装arpack遇到阻力，求助：lurencyj请关注下，谢谢
已经有29人回复
- MS6.0-for-linux在REHL下安装的问题
已经有21人回复
- liunx安装AutoDock
已经有5人回复
- 请教MS4.4 Linux下安装提示 msiinstall语法错误
已经有14人回复
- 【求助】谁能帮我解决在linux下安装ms出现的问题啊
已经有8人回复
- 【求助】求 linux系统下fiuent的安装说明
已经有3人回复
- 【原创】分子对接，同源模建，分子动力学软件介绍帖
已经有35人回复
- 【求助】Linux下gaussian09安装问题请教
已经有6人回复
- 【原创】linux 下 icc+MKL 方案编译安装 gamess
已经有62人回复
- 【求助】MS在LINUX下的安装问题
已经有22人回复
- 【资源】ADF软件linux下的安装与参数设定
已经有33人回复
3楼2012-09-08 17:19:38
2楼2012-09-08 17:14:46
4楼2012-09-10 09:18:00
5楼2012-09-12 18:35:40
6楼2012-09-24 17:39:10
7楼2012-09-24 17:39:48
8楼2012-09-24 21:49:01
9楼2013-03-19 09:56:39
