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redhua

新虫 (初入文坛)

[求助] 有谁做过古细菌的454测序?

我想用454测序测定样品中的古细菌多样性。
那去测序之前,应该如何进行样品处理?
PCR引物,条件等
谢谢!
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anyanqiu

银虫 (初入文坛)

你这样品中只含有古细菌吗,如果是的话直接利用宏基因组测序(利用的是16srRNA的方法,引物有可参考的)就可以,这种方法可以分析不同样品中的古细菌种类差异和每种古细菌的数量差异,但是如果你想从样品中分离出古细菌,那你就只能找到古细菌特异的引物了,不过应该很难做到。实在没有办法时就只能利用宏基因组方法,加大测序深度,从中挖掘出古细菌的信息,不过这种方法,数据分析较难啊。可以利用anan_1223@sina.com这个邮箱联系我,或者你可以给我个邮箱,我把相关信息发给你看看,呵呵!
2楼2012-09-07 07:50:24
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