| 查看: 570 | 回复: 0 | |||
mengyan142木虫 (小有名气)
|
[求助]
ONIOM 显性溶剂 优化出错
|
|
我用高斯ONIOM方法优化蛋白质，初始结构是跑完动力学的结构，该结构有乙腈溶剂，乙腈的参数是用amber里的resp拟合得来的，ONIOM优化时我把乙腈的参数写在了输入文件里，但是提交作业后，很快就跳出来，如下： Cartesian Forces: Max NaN RMS NaN GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad Berny optimization. Internal Forces: Max NaN RMS NaN Search for a local minimum. Step number 2 out of a maximum of 225 All quantities printed in internal units (Hartrees-Bohrs-Radians) Update second derivatives using D2CorX and points 2 DE= NaN DEPred=-1.68D-01 R= NaN Trust test= NaN RLast= 2.00D-02 DXMaxT set to 5.00D-02 Iteration 1 RMS(Cart)= 0.00000000 RMS(Int)= 0.00000000 H-V products w/o non-bonded: 1 Davidson Disk Diagonalization is being used: MVecIn= 15 MSekIn= 16 NVConv= 1 MConv= 1 WhenSc= 5 IFact= 4 FinIt=F NRoot= 15 Conv= 1.00D-05 MaxIt= 1000000000 Dim= 11148 Max sub= 400 *** WARNING: Number of orthogonal guesses is 9 Iteration 1 internal iteration 1 dimension is 9 而且输出文件里有很多的星号。 我用同样的方法优化正己烷溶剂的就没有问题？ 求指点  |
回复此楼» 猜你喜欢
Tc数据拟合
已经有1人回复
-
韩国釜山大学储能电池与功能材料实验室诚招博后（电池/电化学/器件制备/MOF合成）
已经有187人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有111人回复
-
祈福！
已经有79人回复
-
散金求好运
已经有315人回复
-
博士生招生, 材料模拟方向，University of South Carolina
已经有0人回复
-
Postdoc position, materials simulations/machine learning, U. of South Carolina
已经有0人回复
-
祈福青基
已经有34人回复
-
香港中文大学（深圳）2026年招聘公告
已经有0人回复
-
牛来！米来！面来！
已经有8人回复
-
2027申博咨询
已经有11人回复
找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~
高斯考虑溶剂效应后优化出错
已经有8人回复
- 高斯03中PCM溶剂模型 优化
已经有9人回复
- Gaussian对分子构型优化加溶剂化与否对最后结果有影响吗？
已经有8人回复
- Gaussian 溶剂化效应 优化不收敛，大家常用什么办法解决？
已经有7人回复
- 【求助】Turbomole激发态优化溶剂化效应的问题
已经有8人回复
- 【分享】给大家推荐一本好书：《液相色谱溶剂系统的选择与优化》
已经有17人回复
点击这里搜索更多相关资源科研从小木虫开始，人人为我，我为人人
投票:
10