| 查看: 513 | 回复: 0 | |||
mengyan142木虫 (小有名气)
|
[求助]
ONIOM 显性溶剂 优化出错
|
|
我用高斯ONIOM方法优化蛋白质,初始结构是跑完动力学的结构,该结构有乙腈溶剂,乙腈的参数是用amber里的resp拟合得来的,ONIOM优化时我把乙腈的参数写在了输入文件里,但是提交作业后,很快就跳出来,如下: Cartesian Forces: Max NaN RMS NaN GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad Berny optimization. Internal Forces: Max NaN RMS NaN Search for a local minimum. Step number 2 out of a maximum of 225 All quantities printed in internal units (Hartrees-Bohrs-Radians) Update second derivatives using D2CorX and points 2 DE= NaN DEPred=-1.68D-01 R= NaN Trust test= NaN RLast= 2.00D-02 DXMaxT set to 5.00D-02 Iteration 1 RMS(Cart)= 0.00000000 RMS(Int)= 0.00000000 H-V products w/o non-bonded: 1 Davidson Disk Diagonalization is being used: MVecIn= 15 MSekIn= 16 NVConv= 1 MConv= 1 WhenSc= 5 IFact= 4 FinIt=F NRoot= 15 Conv= 1.00D-05 MaxIt= 1000000000 Dim= 11148 Max sub= 400 *** WARNING: Number of orthogonal guesses is 9 Iteration 1 internal iteration 1 dimension is 9 而且输出文件里有很多的星号。 我用同样的方法优化正己烷溶剂的就没有问题? 求指点 |
» 猜你喜欢
北京交通大学王熙教授团队招收2026年入学催化方向博士研究生(还有1个名额)
已经有0人回复
华北电力大学(北京)(第一性原理计算)博士招生——学博,专博各1人
已经有45人回复
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有263人回复
英国贝尔法斯特女王大学招收 2026 年 CSC/BBSRC phd 机器学习 催化剂设计方向
已经有0人回复
法国里昂大学招生CSC 资助博士生
已经有0人回复
法国里昂大学接收CSC 资助访问学者
已经有0人回复
伦敦大学学院Benjamin Moss博士招收人工智能、原位光谱、催化相关26年博士生
已经有11人回复
北京工业大学材料科学与工程学院《院士团队》招收工程专业博士研究生(计算优先)
已经有1人回复
帮导师招2026CSC博士(巴塞罗那自治大学UAB-CSC博士项目)
已经有17人回复
有没有LIMS客户的资源,求推荐
已经有0人回复
找到一些相关的精华帖子,希望有用哦~
高斯考虑溶剂效应后优化出错
已经有8人回复
高斯03中PCM溶剂模型 优化
已经有9人回复
Gaussian对分子构型优化加溶剂化与否对最后结果有影响吗?
已经有8人回复
Gaussian 溶剂化效应 优化不收敛,大家常用什么办法解决?
已经有7人回复
【求助】Turbomole激发态优化溶剂化效应的问题
已经有8人回复
【分享】给大家推荐一本好书:《液相色谱溶剂系统的选择与优化》
已经有17人回复
科研从小木虫开始,人人为我,我为人人











回复此楼
点击这里搜索更多相关资源