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书万里

木虫 (著名写手)

历史控+原著控

[求助] 超胞大小对吸附能有何影响? 已有1人参与

小弟用3X3超胞得到的吸附能是负值,与文献报道差不多。可是换成2X2后,得到的吸附能竟然成为正值。小弟重复算了很多次,还是只能得到正值。我用的是castep。
问题1:ms帮助文件文件中说,优化表面吸附时,可以将力收敛标准改小。我现在用的是0.03ev/A,而我优化时,力标准都是达不到的(其他两个标准达到了,castep也认为找到最低能量构型了)。我想问,我可以把这个值改到多大呢?还有,力不收敛对最终构型有何种影响?
问题2:是什么原因让吸附能发生如此大的变化?是覆盖度?如果是覆盖度的影响,那么一般吸附计算,选择多大覆盖度为宜呢?
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喂人民服雾。
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yourne

木虫 (小有名气)

castep计算吸附能是不是都要用成键模型?不太懂,问问楼主~
“自由有许多困难,民主亦非完美,然而我们从未建造一堵墙把我们的人民关在里面,不准他们离开我们。” ——肯尼迪
2楼2012-09-20 21:26:21
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书万里

木虫 (著名写手)

历史控+原著控

引用回帖:
2楼: Originally posted by yourne at 2012-09-20 21:26:21
castep计算吸附能是不是都要用成键模型?不太懂,问问楼主~

  我还以为这个帖子已经沉了,没想到还有人来啊。
什么叫成键模型,不懂。
喂人民服雾。
3楼2012-09-21 08:09:00
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llilanlanabc

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
书万里: 金币+5, ★有帮助, 谢谢 2012-09-21 10:31:51
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-09-22 10:48:51
建立一个较大的超胞,可以避免吸附原子与其镜像之间的相互作用
4楼2012-09-21 08:40:53
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yourne

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 书万里 at 2012-09-21 08:09:00
  我还以为这个帖子已经沉了,没想到还有人来啊。
什么叫成键模型,不懂。...

嘿嘿,搜索到的。
就是吸附质原子和固体表面的原子之间有没有键合?
“自由有许多困难,民主亦非完美,然而我们从未建造一堵墙把我们的人民关在里面,不准他们离开我们。” ——肯尼迪
5楼2012-09-21 09:30:30
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书万里

木虫 (著名写手)

历史控+原著控

引用回帖:
5楼: Originally posted by yourne at 2012-09-21 09:30:30
嘿嘿,搜索到的。
就是吸附质原子和固体表面的原子之间有没有键合?...

一般不这样说吧,只用键长来表示相互作用大小。
喂人民服雾。
6楼2012-09-21 09:41:38
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故乡的一抹风

新虫 (小有名气)

楼主吸附能最后能算出是负值么
7楼2015-06-19 14:20:45
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前田庆次

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

小弟用3X3超胞得到的吸附能是负值,与文献报道差不多。可是换成2X2后,得到的吸附能竟然成为正值。小弟重复算了很多次,还是只能得到正值。我用的是castep。
问题1:ms帮助文件文件中说,优化表面吸附时,可以将力收敛标准改小。我现在用的是0.03ev/A,而我优化时,力标准都是达不到的(其他两个标准达到了,castep也认为找到最低能量构型了)。我想问,我可以把这个值改到多大呢?还有,力不收敛对最终构型有何种影响?
文献多为0.02及0.01
问题2:是什么原因让吸附能发生如此大的变化?是覆盖度?如果是覆盖度的影响,那么一般吸附计算,选择多大覆盖度为宜呢?
这个怎么说呢……是要做测试的……
但是你这个2X2明显不行,分子之间有作用了……所以能量是正的……
长枪一横花飘零,松风追月伴我行。无双人间世如梦,倾奇万世永留名。
8楼2015-06-20 13:24:23
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

引用回帖:
8楼: Originally posted by 前田庆次 at 2015-06-20 13:24:23
小弟用3X3超胞得到的吸附能是负值,与文献报道差不多。可是换成2X2后,得到的吸附能竟然成为正值。小弟重复算了很多次,还是只能得到正值。我用的是castep。
问题1:ms帮助文件文件中说,优化表面吸附时,可以将力 ...

经验上来说,如果边长不超过5A估计也就只有H能够吸附了,force的标准达不到很有可能截断能和k没经过测试,不过必须承认castep这点不及DMol3,DMol3中force很难收敛的时候如果k测试能够满足force收敛,可以更换为直角坐标并使用GDIIS。力不收敛得到的能量不准确。表面吸附非常建议用局域基组,平面波处理真空层难度颇大。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
9楼2015-06-20 14:38:41
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前田庆次

木虫 (著名写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 卡开发发 at 2015-06-20 14:38:41
经验上来说,如果边长不超过5A估计也就只有H能够吸附了,force的标准达不到很有可能截断能和k没经过测试,不过必须承认castep这点不及DMol3,DMol3中force很难收敛的时候如果k测试能够满足force收敛,可以更换为直 ...

又见大神!
长枪一横花飘零,松风追月伴我行。无双人间世如梦,倾奇万世永留名。
10楼2015-06-20 15:17:30
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