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crystallynn

新虫 (初入文坛)

[求助] 巢式PCR

用8f/1492r  和  L1401/U968   两对引物进行巢式PCR.
第一轮产物用琼脂糖检测有条带,阴性对照无条带。
第二轮产物检测也有目的条带,但是阴性对照也有相应大小的条带。把水,引物,MIX都更换了,一样的结果。求解释啊。。~~~~谢谢~
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baby1987

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
第一轮空白是因为PCR反应条件的关系,小片段没有竞争优势,或者温度不适合引物扩增。你做阴性对照的目的是什么?
加油。
10楼2012-09-01 13:42:04
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
个人觉得,应该是第二对引物特异性不好。可以把两个都测个序看。最好再换1对引物。
2楼2012-08-31 07:17:28
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crystallynn

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by chenguestc at 2012-08-31 07:17:28
个人觉得,应该是第二对引物特异性不好。可以把两个都测个序看。最好再换1对引物。

今天只用第对引物做了一下,果然阴性还是有很暗的条带。。。看了是第二对引物的问题。怎么对引物测序啊?谢谢
3楼2012-08-31 11:55:46
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-09-05 13:52:15
引用回帖:
3楼: Originally posted by crystallynn at 2012-08-31 11:55:46
今天只用第对引物做了一下,果然阴性还是有很暗的条带。。。看了是第二对引物的问题。怎么对引物测序啊?谢谢...

不是对引物测序,对你的PCR产物测序。但是如果第一次PCR,阴性对照也有带就不好办了。说明你的水有问题,或者引物不特异或许在病毒或细菌中能扩增,或许灭菌不彻底?
4楼2012-08-31 14:41:02
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