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hzxm0316

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
10楼: Originally posted by xiongyaoling at 2012-08-31 09:05:47
首先得确定你的目的条带连上了吗?菌落PCR没有结果,可能是酶切和连接上出上问题。扩增得到200bp,这应该是引物二聚体吧。

我也觉得扩出来的是引物二聚体,曾以为连接效率低,可是和实验操作技术比较成熟的同学讨论,发觉我的操作没什么问题,所以现在苦恼着不知道问题在哪儿
11楼2012-09-02 15:59:00
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hzxm0316

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by chenguestc at 2012-08-31 06:53:28
如果分子量都不对,那我觉得是从最开始找问题应该,每一步都CHECK一下。
PCR之后,跑胶,请加MARKER标定PCR产物分子量。
回收之后,请把回收产物用2-3微升跑胶,看分子量是否正确。
如果正确,连接转化。
转化后 ...

谢谢,你的实验态度很谨慎,值得学习!可是我觉得不是分子量的问题,最后得到的200bp可能是引物二聚体,也就是说目的片段丢失,没有克隆出来
12楼2012-09-02 16:06:03
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hzxm0316

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by gwd0312 at 2012-08-30 10:14:59
PCR很可能扩增得到有条带的假阳性克隆,你P的同时最好做个酶切验证,验证结果一致的再测序,这样是你需要的东东的可能性就更大!

谢谢
13楼2012-09-02 16:08:09
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hzxm0316

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 王礼鹏 at 2012-08-30 09:58:02
会不会你挑的菌是假阳性的呀,多挑几个试试,或酶切看看

谢谢
14楼2012-09-02 16:08:19
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jasminezhao

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by chenguestc at 2012-08-30 13:12:12
如果你测序后获得800bp,但是比对没有同源性序列,说明是一个新序列。
如果测序结果只有200,只能说明你连接上的片段不对,或者是假阳性。最好,菌落PCR验证时,用通用引物和你自己的特异引物同时扩增来验证。

你所说的同时用通用引物和特异性引物来扩增是指做两个PCR对照还是加在同一管里进行PCR?
15楼2013-01-04 21:05:18
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

两个PCR哈。如果你的退火温度两对引物一样,一起做也是可以的,最好是分开做,这样看的更清楚,同一个模板用2对引物的结果点样在2个临近泳道。
16楼2013-01-05 18:43:28
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