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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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llg1987

版主

鱼馆的鲢鱼，其他家族的小罗

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！

[求助] 空位迁移能的计算

请问具体的空位的迁移能是怎么通过vasp计算的，我现在用的方法是：将空位移动目的地的那个原子一步一步的沿直线向空位移动，然后分别写出每移动一步之后的原子坐标，生成poscar，通过优化和静态计算来获得系统的能量，在计算的过程中选择的是所有的原子全弛豫。不知道我的这个方法是不是对的？还有要不要建立超胞，我的是16个原子的一个单胞，请知道的或计算过的虫友们给以指导，谢谢了。
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国学养生堂家族欢迎您！http://emuch.net/bbs/group.php?gid=119
1楼 2012-08-19 09:28:36
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liliangfang

禁虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
llg1987: 金币+2, ★有帮助, 感谢交流 2012-08-19 10:30:24
xueht987: 金币+2, 正解！ 2012-08-19 10:52:19
建议看看vasp说明里面的NEB，在初始和终止中间插入点计算
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2楼2012-08-19 10:20:57
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llg1987

管理员

鱼馆的鲢鱼，其他家族的小罗

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
引用回帖:
2楼: Originally posted by liliangfang at 2012-08-19 10:20:57
建议看看vasp说明里面的NEB，在初始和终止中间插入点计算

能否稍微仔细一点，我在说明说的目录里面没有找到NEB啊。
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国学养生堂家族欢迎您！http://emuch.net/bbs/group.php?gid=119
3楼2012-08-19 10:36:25
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liliangfang

新虫

【答案】应助回帖

★ ★
WDD880227: 金币+2, 感谢版主指教 2012-08-20 09:57:04
引用回帖:
3楼: Originally posted by llg1987 at 2012-08-19 10:36:25
能否稍微仔细一点，我在说明说的目录里面没有找到NEB啊。...

vasp里面是nudged elastic band
另外你可以在论坛里面搜索
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1779755
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4楼2012-08-19 11:20:15
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liliangfang

新虫
★ ★
xueht987: 金币+2, 鼓励交流！ 2012-08-22 14:30:32
引用回帖:
3楼: Originally posted by llg1987 at 2012-08-19 10:36:25
能否稍微仔细一点，我在说明说的目录里面没有找到NEB啊。...

要是用vasp的NEB
先用VASP优化出初始态和终了态。初始态和终了态就是你说的迁移的最初位置和你最后要的位置
用脚本按照差值取出一系列中间结构。
INCAR中设置SPRING=-5，MAGES=数量（必须是核的整数倍）。
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5楼2012-08-19 11:24:10
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liliangfang

新虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
llg1987: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 非常感谢 2012-08-20 08:28:16
xueht987: 金币+2, 鼓励交流！ 2012-08-22 14:32:06
引用回帖:
3楼: Originally posted by llg1987 at 2012-08-19 10:36:25
能否稍微仔细一点，我在说明说的目录里面没有找到NEB啊。...

你要是用vasp的NEB可以用附件的插点
附件中时在初始和终止中间插入4个点的脚本，你照着在00和05里面分布放入初始和终止的CONTCAR，其他文件夹不动，然后运行doneb，最后运行clean。
NEB插点.rar 等2个文件
http://kuai.xunlei.com/d/GKLNDMWPSOYC?p=130497
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6楼2012-08-19 11:31:51
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phys

主管区长

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
还有一种叫C-NEB的吗？
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JustPhysics
7楼2012-08-21 09:50:49
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刘小伟110

实习版主

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
引用回帖:
6楼: Originally posted by liliangfang at 2012-08-19 11:31:51
你要是用vasp的NEB可以用附件的插点
附件中时在初始和终止中间插入4个点的脚本，你照着在00和05里面分布放入初始和终止的CONTCAR，其他文件夹不动，然后运行doneb，最后运行clean。
NEB插点.rar 等2个文件
http ...

lz你好，请问在插点的过程中，如果你感觉在02-03之间可能，要继续在02-03之间插点，但是你要设定边界时，是按原来的POSCAR的位置，还是按OUTCAR的位置？
赞一下 回复此楼
慢慢的思考。。。
8楼2014-02-18 15:22:26
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liliangfang

新虫
引用回帖:
8楼: Originally posted by 刘小伟110 at 2014-02-18 15:22:26
lz你好，请问在插点的过程中，如果你感觉在02-03之间可能，要继续在02-03之间插点，但是你要设定边界时，是按原来的POSCAR的位置，还是按OUTCAR的位置？...

我算的是按原来的，插入之后再重新计算
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9楼2014-02-19 07:46:23
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刘小伟110

专家顾问

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
引用回帖:
9楼: Originally posted by liliangfang at 2014-02-19 07:46:23
我算的是按原来的，插入之后再重新计算...

也就是说你是按原来POSCAR的位置，而不是按优化后OUTCAR的位置，那么你能找到过渡态不？你感觉哪个比较合理呢？
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慢慢的思考。。。
10楼2014-02-19 08:35:33
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