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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 当使用资源较多的时候，计算出错
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gleerat

木虫 (正式写手)

[求助] 当使用资源较多的时候，计算出错

我今天发现，当我使用计算资源较多的时候，某些体系的计算无法进行。
在天河上我使用（四个节点）共16个进程测试vasp，计算的是一个较小的体系，只有一个B原子。结果提示错误
引用回帖:
entering main loop
       N       E                     dE             d eps       ncg     rms          rms(c)
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            1
  -2996.61116147347     
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            2
-2.707873607131731E-002
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            3
-3.033957209473841E-002
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            4
  5.402574838824559E-003
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            5
-3.421703911152301E-002
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            1
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            1
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            1
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            1
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            1
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            1
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            1
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            1
  -2996.61116147347     

但是当我将进程数降到4和8的时候，计算正常进行并正常结束。
当计算体系切换为11个原子的时候，开16个进程计算也正常进行。
同样，今天在我们学校的集群上测试LiB的截断能的时候，4个原子的体系，开的24个进程（两个节点），同样错误（当截断能高到一定值的时候，计算正常进行）。鉴于上述经验，我将进程调整为4（两个节点）的时候（没有其他测试，只是简单调整为4），正常进行。
请问

[ Last edited by gleerat on 2012-8-18 at 18:34 ]
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1楼 2012-08-18 18:31:40
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