应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 当使用资源较多的时候，计算出错
11/1返回列表
查看: 557  |  回复: 0
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

gleerat

木虫 (正式写手)

[求助] 当使用资源较多的时候，计算出错

我今天发现，当我使用计算资源较多的时候，某些体系的计算无法进行。
在天河上我使用（四个节点）共16个进程测试vasp，计算的是一个较小的体系，只有一个B原子。结果提示错误
引用回帖:
entering main loop
       N       E                     dE             d eps       ncg     rms          rms(c)
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            1
  -2996.61116147347     
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            2
-2.707873607131731E-002
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            3
-3.033957209473841E-002
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            4
  5.402574838824559E-003
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            5
-3.421703911152301E-002
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            1
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            1
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            1
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            1
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            1
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            1
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            1
WARNING: Sub-Space-Matrix is not hermitian in DAV            1
  -2996.61116147347     

但是当我将进程数降到4和8的时候，计算正常进行并正常结束。
当计算体系切换为11个原子的时候，开16个进程计算也正常进行。
同样，今天在我们学校的集群上测试LiB的截断能的时候，4个原子的体系，开的24个进程（两个节点），同样错误（当截断能高到一定值的时候，计算正常进行）。鉴于上述经验，我将进程调整为4（两个节点）的时候（没有其他测试，只是简单调整为4），正常进行。
请问

[ Last edited by gleerat on 2012-8-18 at 18:34 ]
回复此楼

» 猜你喜欢
明察、慎思、笃行
1楼 2012-08-18 18:31:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

智能机器人

Robot (super robot)

我们都爱小木虫

找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~

科研从小木虫开始，人人为我，我为人人
相关版块跳转 我要订阅楼主 gleerat 的主题更新
11/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 7lpolszZVXgi 2026-08-14 9/450 2026-08-15 17:46 by 7huP8NPKZCp9
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 P4JhWrbJGjSe 2026-08-14 5/250 2026-08-15 15:46 by QXtWNz7PI7wZ
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 5/250 2026-08-15 14:58 by QXtWNz7PI7wZ
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +10 majunge000 2026-08-10 13/650 2026-08-15 12:26 by hanpeng972
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 HFw0lei2R37i 2026-08-14 9/450 2026-08-15 11:33 by KxMI1BYBxWX1
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 7lpolszZVXgi 2026-08-14 6/300 2026-08-15 09:28 by sunzitan
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 5/250 2026-08-15 07:09 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] filecode +7 cratir 2026-08-14 11/550 2026-08-15 06:19 by 学员8dgXkO
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果？ +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 5/250 2026-08-14 22:32 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 奇怪，两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +23 Lanmanbaby 2026-08-09 37/1850 2026-08-14 13:40 by Equinoxhua
[基金申请] 我的国基提前知道中了，可是同事的操作让我实在接受不了，怎么会有这样的人 +10 家与远方 2026-08-10 15/750 2026-08-14 02:08 by 绵羊哥哥
[基金申请] 重要来源：本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] Filecode 又变了，巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见，大家看看几个A，几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分？ +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 什么时候出结果，有咨询渠道？？？ +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 确定了，国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭