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lijuanshu

铜虫 (正式写手)

[交流] 用NEB计算能垒，为什么从次稳定位置扩散到稳定位置和其相反过程所计算得能垒相同？？

各位虫子们，大家好，我在用NEB计算能垒的时候，取8个点，H原子从表面的次稳定位置扩散到最稳定位置的各个能量如下：
00：-173.41179
01：-173.35976
02：-173.08914
03：-172.86400
04：-172.80730
05：-172.83323
06：-172.94465
07：-173.18817
08：-173.38228
09：-173.42062
能量最低点与最高点的差值为0.613
其相反过程，也就是从最稳定位置扩散到此稳定位置，各能量为：
00：-173.42062
01：-173.38227
02：-173.18806
03：-172.94459
04：-172.83321
05：-172.80731
06：-172.86399
07：-173.08906
08：-173.35973
09：-173.41179
能量最低点与最高点的差值为也0.613，如果从最后一行倒过来看，所有的能量与前面过程的相同，不过这两个相反过程的能垒应该不一样啊，不知道为什么，还请虫友们帮忙解决，不胜感激
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1楼 2012-08-14 08:49:49
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lu881688

金虫 (正式写手)
★ ★
lijuanshu(金币+1): 谢谢参与
WDD880227: 金币+1, 多谢提示 2012-08-15 08:58:20
00 应该是一个稳态，09 应该是另一稳态。能量差距小，正、逆向势垒接近也可以理解嘛。
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2楼2012-08-14 09:28:08
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lijuanshu

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lu881688 at 2012-08-14 09:28:08
00 应该是一个稳态，09 应该是另一稳态。能量差距小，正、逆向势垒接近也可以理解嘛。

但是文献上算出来的能垒都是不一样的，并且我算另一个体系的初态能量是-202.76940，末态能量是-202.92948，它的能垒与逆过程的能垒还是一样的，这是为什么啊？
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3楼2012-08-14 09:40:59
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scnlong

木虫 (小有名气)
★
lijuanshu(金币+1): 谢谢参与
我觉得一样才是正常啊。   

正逆过程走的都是同一个路径，能垒应该一样的。

楼主为什么觉得应该不一样？
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4楼2012-08-14 11:49:47
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lijuanshu

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by scnlong at 2012-08-14 11:49:47
我觉得一样才是正常啊。   

正逆过程走的都是同一个路径，能垒应该一样的。

楼主为什么觉得应该不一样？

怎么说呢，这个意义我也不是太懂，总是觉得从最稳定位置扩散的次稳定位置与其逆过程的意义不同，所需要克服的能垒也是不同的，我看的一些文献中的正逆过程的能垒值都是不同的
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5楼2012-08-14 13:28:23
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
★
lijuanshu(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
5楼: Originally posted by lijuanshu at 2012-08-14 13:28:23
怎么说呢，这个意义我也不是太懂，总是觉得从最稳定位置扩散的次稳定位置与其逆过程的意义不同，所需要克服的能垒也是不同的，我看的一些文献中的正逆过程的能垒值都是不同的...

应该都是一样的。

可以理解为一个人在同一条路上来回走。路上海拔最高点与最低点之差是没有变化的。因为路都是一样的。
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7楼2012-08-14 18:04:07
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lijuanshu

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by cenwanglai at 2012-08-14 18:04:07
应该都是一样的。

可以理解为一个人在同一条路上来回走。路上海拔最高点与最低点之差是没有变化的。因为路都是一样的。...

那怎么解释文献中计算得正逆过程的能垒值是有差别的，难道是取的路劲不同?
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8楼2012-08-14 19:08:26
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魔鬼中的天使

金虫 (小有名气)
★
lijuanshu(金币+1): 谢谢参与
这个。。。
能垒应该都是用能量极大值减初始能量值吧
就是说次稳定态容易去稳定态（能垒低）
但稳定态去次稳定态较难（能垒高）
你这个计算结果没什么问题
走的路径一样，自然各个点能量一样
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9楼2012-08-14 19:53:41
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scnlong

木虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by lijuanshu at 2012-08-14 19:08:26
那怎么解释文献中计算得正逆过程的能垒值是有差别的，难道是取的路劲不同?...

你看到的是哪篇文献？
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10楼2012-08-14 20:20:47
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lijuanshu

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 魔鬼中的天使 at 2012-08-14 19:53:41
这个。。。
能垒应该都是用能量极大值减初始能量值吧
就是说次稳定态容易去稳定态（能垒低）
但稳定态去次稳定态较难（能垒高）
你这个计算结果没什么问题
走的路径一样，自然各个点能量一样

按你的意思，从次稳定位置到最稳定位置的能垒低，而从最稳定位置到次稳定位置的能垒高，是这样理解的吗？如果是，我就是想问为什么我从次稳定到最稳定与从最稳定到次稳定的能垒相同啊？
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11楼2012-08-14 21:15:20
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lijuanshu

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by scnlong at 2012-08-14 20:20:47
你看到的是哪篇文献？...

First principles calculations of the adsorption and diffusion of hydrogen on Fe(1 0 0) surface and in the bulk
文中说到The above results indicate that the diffusion barrier between 2F and 4F sites is quite small with values of 1.93 and 1.77 kcal/mol for direct and reverse pathways.
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12楼2012-08-14 21:20:47
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leozpj

新虫 (著名写手)
★
lijuanshu(金币+1): 谢谢参与
哪位能帮忙解释一下计算neb顺利收敛，用nebbarrier.pl生成了neb.dat文件以后，再用nebspline.pl命令显示出了一下报错信息:"Illegal division by zero at /public/home/pjzuo/bin/nebspline.pl line 70.”
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13楼2012-11-06 10:31:48
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dingdingkeai6楼
2012-08-14 14:15   回复  
lijuanshu(金币+1): 谢谢参与
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