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从plink 到beagle，在转换格式时，遇到的问题
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各位乡亲父老， 最近需要做phasing的工作，因此需要把数据从plink的ped,map格式，转换为beagle软件里的Genotypes file format。 其中用的一个pipeline，中间出现了错误信息，但是找不到解决原因，特来请教各位！ 错误信息如下：Exception in thread "main" java.lang.IllegalArgumentException: missing out argument at c.d.a(Unknown Source) at c.d.a(Unknown Source) at phaser.Z. at phaser.PhaseMain. at phaser.PhaseMain.main(Unknown Source) ERROR: out.pre_phase.bgl.phased does not exist or is empty |
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