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Tinker的proper dihedral的是能函数形式是什么？
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请问Tinker的proper dihedral的是能函数形式是什么？我想把他接到Gromacs里面 一篇文献中的输入文件是这样写的： ## Torsional Parameters ## torsion 1 1 1 1 1.300 0.0 1 -0.050 180.0 2 0.200 0.0 3 torsion 1 1 202 203 0.612 0.0 1 0.107 0.0 2 -0.572 0.0 3 0.024 0.0 4 -0.127 0.0 5 torsion 1 1 203 202 -0.292 0.0 1 0.004 0.0 2 -0.914 0.0 3 -0.111 0.0 4 torsion 1 203 203 1 7.250 180.0 2 我查了Tinker的manual，一直没能找到它的函数形式， 自己感觉好像是 V=Σ 1/2[1+cos(nΦ-Φ0)]的形式，不知道对不对？ 是不是不同的二面角用了不同的项数，比如第一个二面角用了3项，第二个用了5项，第三个用了4项，第四个只用了第二项？ 请高手指教一下，说得详细一点儿。 [ Last edited by mengsk on 2012-8-5 at 14:06 ] |
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