| 查看: 4460 | 回复: 13 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
hengyue5257木虫 (著名写手)
|
[求助]
高通量测序分析微生物物种的丰度
|
||
|
最近想利用高通量测序仪来分析环境微生物群落，问个问题。高通量测序能分析微生物的丰度至属吗？华大说用Illumina测序16S rRNA只能分析至科，这样对我来说意义不大，如果能分析到属，意义就大多了。是否真的如华大所述？ 由于目前只想知道物种的丰度，不想了解功能基因，所以只想测16S rRNA。如果能有意义才会去做de nove 测序。 另外能否自己扩增出V6区，然后用454测序而不用Illumina测序？ 望高手赐教！ |
回复此楼» 猜你喜欢
考研求调剂
已经有4人回复
-
085601专硕，总分342求调剂，地区不限
已经有4人回复
-
085601材料工程专硕求调剂
已经有5人回复
-
一志愿天津大学化学工艺专业（081702）315分求调剂
已经有6人回复
-
能源材料化学课题组招收硕士研究生8-10名
已经有6人回复
-
296求调剂
已经有5人回复
-
0703化学调剂 ，六级已过，有科研经历
已经有8人回复
-
268求调剂
已经有8人回复
-
材料，纺织，生物（0856、0710），化学招生啦
已经有7人回复
-
301求调剂
已经有5人回复
| 您好！现在454平台已经升级了，可以做到3个V区，如V1-V3，V3-V5，V4-V6，定位到属应该是没问题的。上海派森诺生物最近做的几个项目，大部分reads分布在500bp以上了，定位到属不是问题！我这边有他们公司一个销售的邮箱，nanjing@personalbio.cn。 |
13楼2013-01-04 21:22:30
girlfisher
金虫 (小有名气)
- 应助: 10 (幼儿园)
- 金币: 1292.1
- 红花: 2
- 帖子: 105
- 在线: 55.9小时
- 虫号: 1049679
- 注册: 2010-06-30
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
2楼2012-08-03 14:17:50
hengyue5257
木虫 (著名写手)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 3586.1
- 红花: 2
- 帖子: 1165
- 在线: 245.8小时
- 虫号: 1270367
- 注册: 2011-04-19
- 性别: GG
- 专业: 污染控制化学
4楼2012-08-03 16:54:21
girlfisher
金虫 (小有名气)
- 应助: 10 (幼儿园)
- 金币: 1292.1
- 红花: 2
- 帖子: 105
- 在线: 55.9小时
- 虫号: 1049679
- 注册: 2010-06-30
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
5楼2012-08-04 10:03:58
50