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jhwang613

木虫 (小有名气)

[求助] 如何评价bruker测试晶体数据结果好坏?

我是一晶体新手,由于实验室前期没人做过这方面的研究,得自己摸索。因此,问的问题可能有点白,请大家勿拍,谢谢!

获得一晶体测试数据,大家一般如何评价晶体数据好坏?因为有的差的数据如果一直纠结,就觉得挺浪费时间的。
1. 何时需要重新定单胞(smart软件),定单胞的过程如何判断?
2. saint plus数据还原过程,如何判断数据好坏,有人说是用cor值,越趋近于1越好?一般小于多少就不需要再解析了?
3. xprep过程,CFOM值如果大于多少?就可以不用考虑了。

或者各位高手有什么好的判断标准,能否分享一下?万分感谢!
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科研与身体并重!
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jhwang613

木虫 (小有名气)

求助啊,求助~各位大侠帮帮忙~~~
科研与身体并重!
2楼2012-08-03 15:35:45
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ww6174

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
linhua0402313: 金币+1, 感谢热心参与,希望对楼主有用 2012-08-03 23:18:03
jhwang613: 金币+9, ★★★很有帮助, 谢谢! 2012-08-06 01:12:26
1、你是说确定晶胞参数?收集了数据可以重新定一次,指标化三个参数均大于90%就足够好了
2、是,越接近一越好,不过经验大于60%足以解结构了
3、CFOM最少大于4,一般要求10左右,太大(>30)也不好)

以上是个人经验
3楼2012-08-03 21:30:17
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
linhua0402313: 金币+2, 感谢热心参与,很详细,希望对楼主有用 2012-08-03 23:18:26
jhwang613: 金币+11, ★★★很有帮助, 挺详细的,谢谢! 2012-08-06 01:12:52
1. 一般情况下, 不用重新定单胞,但是有时候后几组数据不符合所用单胞,就要重新定了。 或者空间群有变化, 比如你在解析的过程中一下子出来好几个一样的分子,这样你可能要考虑用更高对称的空间群了,这时候要考虑重定单胞。

2. cor值越趋近于1 越好是对的, 但一般情况下大于0.5 就能解出结构。

3. CFOM值越小越好,一般小于4.0就没问题。但是大于10.0的话可能说明数据不够好,或者要重新定单胞,还原。但是这个也不绝对, CFOM大于10.0 不是说明你的结构解不出来,有时候只是结构不能收敛罢了。
学无止境
4楼2012-08-03 23:04:53
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jhwang613

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by cluster8676 at 2012-08-03 23:04:53
1. 一般情况下, 不用重新定单胞,但是有时候后几组数据不符合所用单胞,就要重新定了。 或者空间群有变化, 比如你在解析的过程中一下子出来好几个一样的分子,这样你可能要考虑用更高对称的空间群了,这时候要考虑 ...

非常感谢您的热心帮助!不知您是否有这方面的资料,就是从晶体重新定单胞(过程需要注意什么?),晶体数据还原(操作步骤?)及晶体解析的具体步骤(及每个步骤可能需要关注的信息)?如果有这方面的资料或者总结,可否发一份给我,我好学习学习。谢谢啦!
科研与身体并重!
5楼2012-08-04 01:37:38
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jhwang613

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by ww6174 at 2012-08-03 21:30:17
1、你是说确定晶胞参数?收集了数据可以重新定一次,指标化三个参数均大于90%就足够好了
2、是,越接近一越好,不过经验大于60%足以解结构了
3、CFOM最少大于4,一般要求10左右,太大(>30)也不好)

以上是 ...

谢谢您的热心帮助!
1,指标化三个参数均大于90%,是什么意思呢?
3,您的意思是不是CFOM大于4就可以不用考虑继续解析了?
科研与身体并重!
6楼2012-08-04 01:40:47
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by jhwang613 at 2012-08-03 12:37:38
非常感谢您的热心帮助!不知您是否有这方面的资料,就是从晶体重新定单胞(过程需要注意什么?),晶体数据还原(操作步骤?)及晶体解析的具体步骤(及每个步骤可能需要关注的信息)?如果有这方面的资料或者总结 ...

这个还真没有资料,都是师兄师姐教的。
学无止境
7楼2012-08-04 03:09:22
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jhwang613

木虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by cluster8676 at 2012-08-04 03:09:22
这个还真没有资料,都是师兄师姐教的。...

真好,有师兄师姐可以教。谢谢啦!
科研与身体并重!
8楼2012-08-04 23:44:11
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ww6174

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by jhwang613 at 2012-08-04 01:40:47
谢谢您的热心帮助!
1,指标化三个参数均大于90%,是什么意思呢?
3,您的意思是不是CFOM大于4就可以不用考虑继续解析了?...

1.就是确定晶胞参数的时候index,hkl分别拟合的参数
3.不好意思看错了(看成信噪比了,orz),cfom当然是越小越好。。。大于10不好解结构
9楼2012-08-05 23:40:10
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