24小时热门版块排行榜    

查看: 2308  |  回复: 8

jhwang613

木虫 (小有名气)

[求助] 如何评价bruker测试晶体数据结果好坏?

我是一晶体新手,由于实验室前期没人做过这方面的研究,得自己摸索。因此,问的问题可能有点白,请大家勿拍,谢谢!

获得一晶体测试数据,大家一般如何评价晶体数据好坏?因为有的差的数据如果一直纠结,就觉得挺浪费时间的。
1. 何时需要重新定单胞(smart软件),定单胞的过程如何判断?
2. saint plus数据还原过程,如何判断数据好坏,有人说是用cor值,越趋近于1越好?一般小于多少就不需要再解析了?
3. xprep过程,CFOM值如果大于多少?就可以不用考虑了。

或者各位高手有什么好的判断标准,能否分享一下?万分感谢!
回复此楼
科研与身体并重!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jhwang613

木虫 (小有名气)

求助啊,求助~各位大侠帮帮忙~~~
科研与身体并重!
2楼2012-08-03 15:35:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ww6174

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
linhua0402313: 金币+1, 感谢热心参与,希望对楼主有用 2012-08-03 23:18:03
jhwang613: 金币+9, ★★★很有帮助, 谢谢! 2012-08-06 01:12:26
1、你是说确定晶胞参数?收集了数据可以重新定一次,指标化三个参数均大于90%就足够好了
2、是,越接近一越好,不过经验大于60%足以解结构了
3、CFOM最少大于4,一般要求10左右,太大(>30)也不好)

以上是个人经验
3楼2012-08-03 21:30:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
linhua0402313: 金币+2, 感谢热心参与,很详细,希望对楼主有用 2012-08-03 23:18:26
jhwang613: 金币+11, ★★★很有帮助, 挺详细的,谢谢! 2012-08-06 01:12:52
1. 一般情况下, 不用重新定单胞,但是有时候后几组数据不符合所用单胞,就要重新定了。 或者空间群有变化, 比如你在解析的过程中一下子出来好几个一样的分子,这样你可能要考虑用更高对称的空间群了,这时候要考虑重定单胞。

2. cor值越趋近于1 越好是对的, 但一般情况下大于0.5 就能解出结构。

3. CFOM值越小越好,一般小于4.0就没问题。但是大于10.0的话可能说明数据不够好,或者要重新定单胞,还原。但是这个也不绝对, CFOM大于10.0 不是说明你的结构解不出来,有时候只是结构不能收敛罢了。
学无止境
4楼2012-08-03 23:04:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jhwang613

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by cluster8676 at 2012-08-03 23:04:53
1. 一般情况下, 不用重新定单胞,但是有时候后几组数据不符合所用单胞,就要重新定了。 或者空间群有变化, 比如你在解析的过程中一下子出来好几个一样的分子,这样你可能要考虑用更高对称的空间群了,这时候要考虑 ...

非常感谢您的热心帮助!不知您是否有这方面的资料,就是从晶体重新定单胞(过程需要注意什么?),晶体数据还原(操作步骤?)及晶体解析的具体步骤(及每个步骤可能需要关注的信息)?如果有这方面的资料或者总结,可否发一份给我,我好学习学习。谢谢啦!
科研与身体并重!
5楼2012-08-04 01:37:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jhwang613

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by ww6174 at 2012-08-03 21:30:17
1、你是说确定晶胞参数?收集了数据可以重新定一次,指标化三个参数均大于90%就足够好了
2、是,越接近一越好,不过经验大于60%足以解结构了
3、CFOM最少大于4,一般要求10左右,太大(>30)也不好)

以上是 ...

谢谢您的热心帮助!
1,指标化三个参数均大于90%,是什么意思呢?
3,您的意思是不是CFOM大于4就可以不用考虑继续解析了?
科研与身体并重!
6楼2012-08-04 01:40:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by jhwang613 at 2012-08-03 12:37:38
非常感谢您的热心帮助!不知您是否有这方面的资料,就是从晶体重新定单胞(过程需要注意什么?),晶体数据还原(操作步骤?)及晶体解析的具体步骤(及每个步骤可能需要关注的信息)?如果有这方面的资料或者总结 ...

这个还真没有资料,都是师兄师姐教的。
学无止境
7楼2012-08-04 03:09:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jhwang613

木虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by cluster8676 at 2012-08-04 03:09:22
这个还真没有资料,都是师兄师姐教的。...

真好,有师兄师姐可以教。谢谢啦!
科研与身体并重!
8楼2012-08-04 23:44:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ww6174

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by jhwang613 at 2012-08-04 01:40:47
谢谢您的热心帮助!
1,指标化三个参数均大于90%,是什么意思呢?
3,您的意思是不是CFOM大于4就可以不用考虑继续解析了?...

1.就是确定晶胞参数的时候index,hkl分别拟合的参数
3.不好意思看错了(看成信噪比了,orz),cfom当然是越小越好。。。大于10不好解结构
9楼2012-08-05 23:40:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 jhwang613 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +7 gdd2018 2026-08-28 12/600 2026-09-01 08:32 by 尼古拉斯小虫
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +6 叶九微 2026-08-26 6/300 2026-08-31 23:54 by yudaoqian88
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +6 yuleib84 2026-08-26 7/350 2026-08-31 19:46 by 鱼翔浅底1
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 基金不中,共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +12 Kittylucky 2026-08-27 13/650 2026-08-29 00:04 by superceng
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
信息提示
请填处理意见