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紫菱Kitty

金虫 (小有名气)

[求助] 有没有人会正交优化培养基?

我问实验室的人了,都说应该设计互相影响的正交表。我本科没学过概率论与数理统计,读研期间数理统计只学了半个学期,正交实验设计那老师还没讲。自己看书看不懂。所以想问一下,各个成分互相影响的正交表怎么设计?
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梦随风万里,几度洪辰来去。人面桃花长相忆。又是一年春华成秋碧,莫叹明月笑多情。
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回帖置顶 ( 共有3个 )

qijilaji

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
silicare: 金币+5, BioEPI+1, 鼓励发帖交流 2012-07-31 16:09:40
先去百度下载一个软件,正交设计助手,非常简单的界面,选好你要设定的因素和水平,软件会自动帮你生成正交实验方案,你照着做就行了。
正交的因素和水平建议你先做做单因素的预试验,确定一下有显著性影响的因素,初步选定变化最大的水平范围,然后再去设计正交实验,否则做不出显著性差异,实验就不成立了。
培养基优化我以前做过5年多,有啥问题欢迎再问
2楼2012-07-30 09:25:46
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qijilaji

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
silicare: 回帖置顶 2012-07-31 16:10:12
silicare: 金币+5 2012-07-31 16:10:14
既然是做正交实验,那肯定是考虑到有相互影响的,不然就没必要做正交了。
单因素实验的话,我解释一下吧,比如基础培养基,考虑到微量元素的话,可能有10种以上的成分,那么你不可能去做10多个因素的正交吧?所以我们要先测试一下,每种成分加和不加,加多少,到底有多重要。
设定某些必须的组分为固定浓度,比如基础的碳源和氮源,其余的组分就一个一个的试,如果你打算做4水平的,那么你就可以设定7个点以上的单因素,12点以上的当然更好……做出曲线之后,有没有显著性,那个范围的影响最大,一目了然,你的水平就可以定了,如果做出来的曲线根本没有起伏,那你就不用考察这个因素了,定个固定值就OK了。
至于响应面分析,个人不建议新手去考虑,只会让你的实验设计更糟。用于微生物培养的培养基,去做响应面,个人觉得,就跟你用10万级天平去配生理盐水是一个道理,有必要么?
8楼2012-07-31 15:33:54
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qijilaji

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
silicare: 金币+5 2012-07-31 16:10:19
silicare: 回帖置顶 2012-07-31 16:10:20
silicare: BioEPI+1 2012-07-31 16:28:29
补充一下,正交实验一般是必须做出至少一个以上的显著性因素,如果你都不知道影响最大的水平范围,直接去做正交,可能有以下两个后果:
一,你设定的水平范围没有包括到最显著的范围,也就是选错水平了
二,你设定的水平范围够大,包括到了最显著的范围,但是,给你举个例子,比如你设定了成分A的浓度为5g/L,10g/L,15g/L和20g/L,你的运气不错,做出来的最佳组合结果是10g/L最佳,那么我要问你,7.5g/L和12.5g/L,就一定比10g/L差么?你无法回答,因为你没有一个完整的单因素曲线。
最后补充一点,假设你做单因素实验,发现了因素A的最佳条件是5g/L,但是最后正交实验的结果未必就是它,这是多因素交互影响的结果,很正常,并不意味着你的实验有问题,你反而可以从中得出更多的假设和结论。
9楼2012-07-31 15:41:08
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普通回帖

weiguoqin111

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
那请问楼上正交设计的水平应该定的范围宽一些尽量差别大吗,因为我没做单因素,不知极值大概在哪,直接设计的正交,可以作莫
everything will be OK,tomorrow will be fine。
3楼2012-07-30 09:48:50
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紫菱Kitty

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by qijilaji at 2012-07-30 09:25:46
先去百度下载一个软件,正交设计助手,非常简单的界面,选好你要设定的因素和水平,软件会自动帮你生成正交实验方案,你照着做就行了。
正交的因素和水平建议你先做做单因素的预试验,确定一下有显著性影响的因素, ...

那你觉得这个正交表应该是互相不影响的还是互相影响的?
梦随风万里,几度洪辰来去。人面桃花长相忆。又是一年春华成秋碧,莫叹明月笑多情。
4楼2012-07-30 18:05:57
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紫菱Kitty

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by qijilaji at 2012-07-30 09:25:46
先去百度下载一个软件,正交设计助手,非常简单的界面,选好你要设定的因素和水平,软件会自动帮你生成正交实验方案,你照着做就行了。
正交的因素和水平建议你先做做单因素的预试验,确定一下有显著性影响的因素, ...

对了,三楼还问你问题呢,你回答一下吧。
梦随风万里,几度洪辰来去。人面桃花长相忆。又是一年春华成秋碧,莫叹明月笑多情。
5楼2012-07-30 18:06:24
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xll8380

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
silicare: 金币+2, 谢谢参与 2012-07-31 16:09:53
既然你的有相会作用,你可以用响应面做啊,如A、B、C 三个因素,响应面可以知道A-A,
B-B,
C-C,
A-B,
A-C
B-C
的显著性啊
6楼2012-07-30 20:15:56
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zhangxiangyu

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
把因素和浓度范围贴出来,我给你设计
知识之败,慕虚名而不务潜修也;品节之败,慕虚荣而不甘枯淡也。
7楼2012-07-31 08:21:08
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