| 查看: 493 | 回复: 2 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
77638333金虫 (著名写手)
|
[求助]
请问这种情况下是不是需要修改原来序列文件
|
|
|
序列文件是Fasta格式的,直接从blast NCBI下载的,当时没有编辑,结果用Clustal进行多重序列比对成了下面的样子,“>”后面的基因名称不见了。这种情况下,有没有必要重新编辑序列文件,将“>”后面的多余符号去掉,只保留物种名称?即“>gb|AE017180.1|:770620-771102 Geobacter sulfurreducens PCA”是不是要改为“Geobacter sulfurreducens PCA”? 谢谢!!! gb|CP002031.1|_749305-749787 --------------TCACCCGGTCACGGCGATG-TCGATGCT-TCCCTCC gb|AE017180.1|_770620-771102 --------------TCACCCGGTCACGGCGATG-TCGATGCT-TCCCTCC gb|CP000698.1|_2567490-2567969 -----------------TCAGTTCACTGTGATA-TCGAGGCT-CCCTTCC gb|CP000148.1|_2960020-2960505 ATGAACAGGAGAACTTTCTTGAAGACGGCGGCCCTTGGGGCCGTGGCTGC * ** * * * * ** * * |
» 猜你喜欢
SEL120-34A HCl:CDK8/CDK19高选择性激酶抑制剂
已经有0人回复
氢氧化钾活化操作
已经有19人回复
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有65人回复
散金
已经有68人回复
生物质超级电容器
已经有0人回复
ALK5 高选择性小分子 LY-3200882:可放大合成路线与质控要点解析
已经有0人回复
AM630(CAS 164178-33-0):CB2 选择性配体的实验使用与供应要点
已经有0人回复
ADC标杆分子T-DM1全解析:从结构设计到实验室应用的技术要点
已经有0人回复
HILIC磁珠研究蛋白组学怎么做?
已经有0人回复
His标签蛋白纯化怎么才能快?
已经有0人回复

chenguestc
木虫 (职业作家)
- MolEPI: 7
- 应助: 576 (博士)
- 贵宾: 0.4
- 金币: 4526.9
- 散金: 1639
- 红花: 176
- 帖子: 4708
- 在线: 353.5小时
- 虫号: 1337860
- 注册: 2011-07-05
- 性别: GG
- 专业: 作物分子育种
3楼2012-07-30 20:38:12
度_T
铁虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1676.8
- 帖子: 31
- 在线: 67.3小时
- 虫号: 1653461
- 注册: 2012-02-29
- 性别: MM
- 专业: 基因表达调控与表观遗传学

2楼2012-07-30 17:20:28









回复此楼