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关于利用限制性内切酶对大量细菌进行快速分型的问题
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有个问题想和大家讨论一下或者请教高人,我们经常可以在文献中看到使用ARDRA方法(限制性)对16s rDNA克隆文库中的大量克隆子进行快速分型,具有相同带型的作为一个OTU,那么可以说一个OTU中的克隆子是一个属的吗?或者说在什么水平上(纲、目还是科)属于一类?我自己思前想后觉得这么下结论不科学,但是在前些年克隆文库方法盛行而高通量测序还没发展起来时,研究者们做生态学方面研究时都会采用ARDRA从大量克隆子中筛选出代表性的拿去测序,说明这个方法还是有一定的科学性的。现在我就是缺少一些证据或者说是多数人的认可,有点怀疑。 大家如果有比较懂的或者有相关文献指明该方法可以将克隆子(微生物16S rRNA gene)精确分类的,麻烦大家顺手推荐一下啊,谢谢 ![]() 欢迎踊跃发言,多多指点 |
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