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tzaixmc

木虫 (正式写手)

[求助] 细菌基因组文库构建的相关问题

目前想要用质粒pUCM-T建一个2-6kb的细菌基因组的质粒文库。实验室没人做过,啥也不懂,望高手出来解答一下。谢谢!
1.  质粒载体酶切后要先切胶回收,再用CIAP处理完后再用切胶回收吗?
2.  2-6kb的回收片段和末端磷酸化的载体连接时加入量多少比较合适?有人说按DNA载体和外源片断以6:1的摩尔比,那要分别加多少够做一次转化?
3.  如果我想建这个库要8000的克隆,那我如果一次转化只有500个怎么办?是多做累积到8000个还是一次多做几管连接转化累计到8000个克隆?
4. 对构建出来的文库我想用池的方式保存。我想要提取里面的质粒转化打另外一株菌中做活性检测,那这个质粒提取我是直接提取一个池的质粒,还是从这个池里接种一点到新的培养基中,培养起来再做转化?
望高手出来解答一下啊,非常感谢!
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tzaixmc

木虫 (正式写手)

我是直接用流式进行筛选并无泳道96孔板。我建议你用封口膜封一下,或者买那种96孔的PCR板封板膜
23楼2013-01-05 09:41:11
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tzaixmc

木虫 (正式写手)

引用回帖:
22楼: Originally posted by hraikeyan at 2013-01-04 12:37:31
我最近买了一批96孔板,听有人说平底的不能用来离心,所以就买了一批圆底的。但是发现圆底的比平底的容量小。而且培养一段时间后菌液会蒸发。培养基越来越少。请问你是用哪种96孔板的(平底还是圆底)?对于培养基 ...

我是直接用流式细胞仪进行筛选并无用到96孔板。我建议你用封口膜封一下,或者买那种96孔的PCR板封板膜
24楼2013-01-05 09:42:07
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