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hyudlut

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 想学动力学，大家推荐一个软件吧 已有4人参与

我想学动力学，研究有机分子在溶液中的构型，可能之后还要加金属离子，什么动力学软件更适合我呀(最好是免费的哦~)。对这个了解的太少了，麻烦各位大侠讲的细一些啦！

[ Last edited by hyudlut on 2012-7-18 at 10:52 ]
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1楼 2012-07-18 10:51:09
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boylc789

木虫 (著名写手)

独孤
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2012-07-18 20:54:22
你就学lammps吧，学会它，打遍天下无敌手
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有种相遇叫缘分；有种责任叫承诺；有份心情叫思念；有种痛苦叫煎熬；有种后悔叫错过；有种等待叫守候。
2楼2012-07-18 13:12:51
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hyudlut

铁杆木虫 (正式写手)
内容已删除
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3楼2012-07-18 14:34:24
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sslovepfy
MS
4楼2012-07-18 17:17:36
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hyudlut

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by sslovepfy at 2012-07-18 17:17:36
MS

MS不是免费的呀，这个预算太多了~
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5楼2012-07-18 17:56:36
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手
★ ★
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-07-18 20:55:02
哈哈~校友啊~俺也是dlut的，我觉得你可以查查类似体系做MD都是用什么的~俺是做酶和小分子的MD的，所以对你这方面不是太熟~哈哈
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6楼2012-07-18 18:01:33
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hyudlut

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by zh1987hs at 2012-07-18 18:01:33
哈哈~校友啊~俺也是dlut的，我觉得你可以查查类似体系做MD都是用什么的~俺是做酶和小分子的MD的，所以对你这方面不是太熟~哈哈

校友呀，握个爪 你们一般用什么软件呀？
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7楼2012-07-19 09:14:49
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by hyudlut at 2012-07-19 09:14:49
校友呀，握个爪 你们一般用什么软件呀？...

我们做生物体系的，用的最多的是namd, gromacs和amber~但是我觉得都不太适合用于你的体系，如果你的体系不是特别大的话，是不是用量化软件，比如gaussian什么的会更好？化院很多老师有这个软件的
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8楼2012-07-19 10:23:35
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PSA

专家顾问 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by zh1987hs at 2012-07-18 18:01:33
哈哈~校友啊~俺也是dlut的，我觉得你可以查查类似体系做MD都是用什么的~俺是做酶和小分子的MD的，所以对你这方面不是太熟~哈哈

做酶和小分子的MD，你用什么软件，谢谢！
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9楼2012-07-19 11:25:21
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手
引用回帖:
9楼: Originally posted by PSA at 2012-07-19 11:25:21
做酶和小分子的MD，你用什么软件，谢谢！...

我用gromacs，不过要是资源允许的话，amber会是更好的选择~
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10楼2012-07-19 11:56:44
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