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hyudlut

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 想学动力学,大家推荐一个软件吧 已有4人参与

我想学动力学,研究有机分子在溶液中的构型,可能之后还要加金属离子,什么动力学软件更适合我呀(最好是免费的哦~)。对这个了解的太少了,麻烦各位大侠讲的细一些啦!

[ Last edited by hyudlut on 2012-7-18 at 10:52 ]
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

★ ★
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-07-18 20:55:02
哈哈~校友啊~俺也是dlut的,我觉得你可以查查类似体系做MD都是用什么的~俺是做酶和小分子的MD的,所以对你这方面不是太熟~哈哈
6楼2012-07-18 18:01:33
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by hyudlut at 2012-07-19 09:14:49
校友呀,握个爪 你们一般用什么软件呀?...

我们做生物体系的,用的最多的是namd, gromacs和amber~但是我觉得都不太适合用于你的体系,如果你的体系不是特别大的话,是不是用量化软件,比如gaussian什么的会更好?化院很多老师有这个软件的
8楼2012-07-19 10:23:35
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

引用回帖:
9楼: Originally posted by PSA at 2012-07-19 11:25:21
做酶和小分子的MD,你用什么软件,谢谢!...

我用gromacs,不过要是资源允许的话,amber会是更好的选择~
10楼2012-07-19 11:56:44
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