24小时热门版块排行榜    

查看: 3084  |  回复: 16
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zhang_jaj

木虫 (正式写手)

[求助] 坐标文件判断是fcc,hcp,bcc,sc等结构的算法或者方法

用towhee模拟ar气低温在界面上的成核行为。出来的结果文件是pdb格式的坐标文件。现在想知道这些原子中哪些部分是固体,哪些部分是液体。还有事固体的怎么来判断结构是fcc还是hcp或者bcc之类的,有什么编程的算法,或者是已有的 软件可以判断吗?总感觉用可视化软件直接看的话不是很靠谱啊
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhang_jaj

木虫 (正式写手)

引用回帖:
13楼: Originally posted by lr553104284 at 2012-07-20 17:47:31
这个不是一两句话能讲清楚的。还是要看文献的!!!但pair analysis和lammps没有必然的联系!当然,你也可以从lammps的输出文件中提炼出原子的位置坐标,并用PA法分析。...

你好,能麻烦您给提供一个Bond-orientational order方法的获得途径吗?你们是自己编程的吗?
16楼2013-06-20 15:59:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答

lr553104284

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-07-17 21:10:37
zhang_jaj: 金币+20, ★★★很有帮助, 非常感谢,我先自己了解下再请教你 2012-07-18 11:58:16
大致有三种比较流行的方法如下:Pair Analysis, Voronoi Polyhedron, Bond Orientational Order Parameter!可以网上查一查,希望对你有所帮助。
2楼2012-07-17 21:05:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lzl8181

铁杆木虫 (著名写手)

单身浏览汉

引用回帖:
2楼: Originally posted by lr553104284 at 2012-07-17 21:05:39
大致有三种比较流行的方法如下:Pair Analysis, Voronoi Polyhedron, Bond Orientational Order Parameter!可以网上查一查,希望对你有所帮助。

老兄,小弟编程能力太低,请问有没有相关软件来做这几种分析?特别是Pair Analysis。
版权乜有,盗用不究!
3楼2012-07-18 11:27:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhang_jaj

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lr553104284 at 2012-07-17 21:05:39
大致有三种比较流行的方法如下:Pair Analysis, Voronoi Polyhedron, Bond Orientational Order Parameter!可以网上查一查,希望对你有所帮助。

你应该比较了解这三种方法吧,能不能简单的点评下这一种方法的适用体系,优劣势,非常感谢!
4楼2012-07-18 12:03:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] (出分啦!!!)26 考研调剂 20w+调剂信息火速更新中!【捡漏】qq 群:1087823172 +3 db58 2026-02-28 133/6650 2026-02-28 18:25 by nbf68
[考研] 0856材料求调剂 +9 hyf hyf hyf 2026-02-28 10/500 2026-02-28 18:22 by liqiongjy
[教师之家] 版面费该交吗 +15 苹果在哪里 2026-02-22 18/900 2026-02-28 18:20 by mibaomingg
[考研] 285求调剂 +5 满头大汗的学生 2026-02-28 5/250 2026-02-28 18:10 by 材料专硕调剂;
[考研] 材料学调剂 +3 提神豆沙包 2026-02-28 3/150 2026-02-28 18:10 by djennjx
[考研] 材料类求调剂 +4 wana_kiko 2026-02-28 4/200 2026-02-28 18:08 by djennjx
[考研] 材料调剂 +3 爱擦汗的可乐冰 2026-02-28 3/150 2026-02-28 18:06 by houyaoxu
[考研] 276求调剂 +3 路lyh123 2026-02-28 3/150 2026-02-28 18:02 by houyaoxu
[考研] 求调剂 +3 repeatt?t 2026-02-28 3/150 2026-02-28 18:00 by houyaoxu
[考博] 博士自荐 +3 kkluvs 2026-02-28 3/150 2026-02-28 16:59 by StarAura
[高分子] 求环氧树脂研发1名 +3 孙xc 2026-02-25 11/550 2026-02-28 16:57 by ichall
[考博] 博士推荐 +4 花儿笑? 2026-02-21 5/250 2026-02-28 16:55 by mumin1990
[考研] 295求调剂 +4 19171856320 2026-02-28 4/200 2026-02-28 13:39 by ms629
[考研] 290求调剂 +4 材料专硕调剂; 2026-02-28 5/250 2026-02-28 13:32 by houyaoxu
[考研] 0856调剂 +3 刘梦微 2026-02-28 3/150 2026-02-28 13:22 by houyaoxu
[硕博家园] 博士自荐 +6 科研狗111 2026-02-26 9/450 2026-02-28 12:32 by seaskyy
[考研] 272求调剂 +3 田智友 2026-02-28 3/150 2026-02-28 12:31 by 王加浩to
[考研] 298求调剂 +4 axyz3 2026-02-28 4/200 2026-02-28 11:21 by wang_dand
[基金申请] 什么是人一生最重要的? +10 瞬息宇宙 2026-02-21 10/500 2026-02-27 08:46 by tfang
[基金申请] 面上可以超过30页吧? +12 阿拉贡aragon 2026-02-22 13/650 2026-02-26 22:09 by Hahaxia
信息提示
请填处理意见