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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » ms构建大分子求助啊！！！
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夏小莫

铜虫 (初入文坛)

[求助] ms构建大分子求助啊！！！

怎样在ms中构建一个聚合物，比如怎样把F2311给构建出来，我知道先做出一个单体，然后聚合，但是我不知道在哪做单体，也不会聚合，能不能有好心人帮我实现一下啊，把具体的步骤给我列一下，本人刚接触这一块，非常不懂，非常感谢了..
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1楼 2012-07-17 11:09:52
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river漾

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by kou_SCI at 2012-08-09 00:15:29
你先画一个单体，然后定义这个单体的头和尾原子（head 和 tail），这个连接的时候就有方向了，然后去build polymer，在repeating unit里面选择本project里面的file，选择你刚built的那个单体，选择聚合度，异构方式 ...

不好意思，是我搞错了，没有问题！谢谢！
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5楼2014-07-26 16:02:38
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kou_SCI

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
jiaoyixiong: 金币+5, 鼓励交流 2012-08-09 08:06:12
你先画一个单体，然后定义这个单体的头和尾原子（head 和 tail），这个连接的时候就有方向了，然后去build polymer，在repeating unit里面选择本project里面的file，选择你刚built的那个单体，选择聚合度，异构方式，点build，就好了。加聚物比较好画，画缩聚物的时候，画重复单元而不是画单体，因为MS不会自动给你做反应脱水，需要键接的头尾原子，你把链接的那个原子连上氢原子，然后把那个氢原子设计成你的头和尾原子就好了。
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2楼2012-08-09 00:15:29
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夏小莫

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by kou_SCI at 2012-08-09 00:15:29
你先画一个单体，然后定义这个单体的头和尾原子（head 和 tail），这个连接的时候就有方向了，然后去build polymer，在repeating unit里面选择本project里面的file，选择你刚built的那个单体，选择聚合度，异构方式 ...

谢谢非常感谢你的方法，怎样将F2311的十条链单独放置在周期箱内啊，能说一下具体步骤吗？
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3楼2012-09-10 09:49:33
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river漾

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by kou_SCI at 2012-08-09 00:15:29
你先画一个单体，然后定义这个单体的头和尾原子（head 和 tail），这个连接的时候就有方向了，然后去build polymer，在repeating unit里面选择本project里面的file，选择你刚built的那个单体，选择聚合度，异构方式 ...

你好，看了你的介绍，很受启发，但是我还是有点问题···如果要建立PET，好像用你说的方法还是不行啊。缩聚的时候一边去掉羟基，另一边去掉氢，在羟基这块是有问题的，没法设置那个碳原子为头/尾原子，只能选择氧原子诶···这个问题要怎么解决呢？麻烦您解答一下，谢谢！
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4楼2014-07-26 15:23:03
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