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fengyunqb

新虫 (小有名气)

[求助] 课题求助。求助。分子生物学

求助求助。。现在我在写自己的课题计划，找不到方向感。我的课题是这样的：我是想克隆鱼类一种基因。这个基因在哺乳动物NCBI已经有确定的基因序列，而鱼类只有斑马鱼、罗非鱼的预测序列，前面有PREDICTED字样。方案一：直接用它自己设计引物克隆斑马鱼的那个预测序列；方案二：改成另外一种鱼，用哺乳动物已知的和鱼类预测的多序列比对寻找保守区设计兼并引物扩增然后RACE，我怕前一种方法不靠谱，后一种方法难度太大，出不来结果。谢谢指点迷津。万分感谢。
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1楼2012-07-15 16:30:23
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克隆大虾

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我怕前一种方法不靠谱?何以见得？你可以验证下predicted ，是否是全长.这方案比你第一种方法更加简单易行.
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2楼2012-07-15 18:22:32
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克隆大虾

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-07-16 13:50:49
fengyunqb: 金币+1, ★★★★★最佳答案 2012-09-11 11:09:42
把斑马鱼里所有该基因的候选基因都拿出来分析。预测的是错的？很有可能说明斑马鱼没有该类基因。其余的conserved domain不相关的更不可能是你的基因。鲫鱼的和斑马鱼的比有什么创新性吗？
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fengyunqb
5楼2012-07-15 20:14:25
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克隆大虾

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by fengyunqb at 2012-07-16 14:06:27
非常感谢你的建议，我现在摸索初期，你的只言片语也会给我带来莫大的帮助，谢谢。没多少金币。

我选做鲫鱼的，因为鲫鱼这个基因没人做过。斑马鱼不好买并且他的那个基因NCBI里面有预测的，即使我克隆成功 ...

如果斑马鱼中该基因功能只是预测，而你把他功能试验搞清楚了，文章档次比鲫鱼的高一个层次，毕竟是模式生物。
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9楼2012-07-16 14:09:07
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克隆大虾

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
fengyunqb: 金币+4, ★★★很有帮助, 很热心的帮助。很有用的建议。 2012-07-17 09:22:43
引用回帖:
10楼: Originally posted by fengyunqb at 2012-07-16 14:17:35
你的建议很中肯，哎，导师都不鸟我，让自己摸索。本来实验室想研究这个基因表达的蛋白和一些药物的作用情况，但试了几次都没刻出来，可能不够专业，RACE-PCR也不靠谱，谢谢你的建议，我找人商量下。谢谢你哦。给我 ...

加油做吧，小伙子...大家都是从那过程走过来的...
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fengyunqb
11楼2012-07-16 15:21:56
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克隆大虾

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

注意克隆cDNA。选用什么宿主表达？
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13楼2012-07-20 15:33:51
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克隆大虾

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

做功能？什么酶？容易做吗？已知的也只是putative，需要你的结构生物学等方法验证功能...
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fengyunqb
15楼2012-07-20 19:27:20
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克隆大虾

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

肯定是斑马鱼的意义大
其他的泥鳅啥的，人家都不公认。当然做模式生物意义大...只是预测，功能未知，也是新基因...
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17楼2012-07-21 12:44:21
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