应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » APBS软件适用范围
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
61/1返回列表
查看: 1513  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

hxy2011

金虫 (小有名气)

[求助] APBS软件适用范围

APBS软件可不可以分析酶蛋白和氨基酸结合?求高手指教啊
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-07-13 20:50:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-07-14 09:38:06
你是要做对接还是干啥？APBS的长处不在于计算酶与氨基酸(小肽？)的结合~
赞一下 回复此楼
2楼2012-07-14 09:11:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hxy2011

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zh1987hs at 2012-07-14 09:11:34
你是要做对接还是干啥？APBS的长处不在于计算酶与氨基酸(小肽？)的结合~

我做的只是酶催化丝氨酸成色氨酸的过程，这样是不是只能用Autodock做对接，看能量变化啊？
赞一下 回复此楼
3楼2012-07-14 13:38:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-07-15 14:18:02
引用回帖:
3楼: Originally posted by hxy2011 at 2012-07-14 13:38:06
我做的只是酶催化丝氨酸成色氨酸的过程，这样是不是只能用Autodock做对接，看能量变化啊？...

你要是比较酶对不同底物的结合情况差异，可以用对接，如果你想模拟丝氨酸变成色氨酸的过程，即底物到产物的变化情况，涉及到键的形成或者断裂就得用量化软件了~
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2012-07-15 11:44:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

comdisc

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by zh1987hs at 2012-07-15 11:44:25
你要是比较酶对不同底物的结合情况差异，可以用对接，如果你想模拟丝氨酸变成色氨酸的过程，即底物到产物的变化情况，涉及到键的形成或者断裂就得用量化软件了~...

请推荐一些量化软件，能够模拟丝氨酸变成色氨酸的过程，即底物到产物的变化情况，涉及到键的形成或者断裂。
赞一下 回复此楼
5楼2013-06-18 17:02:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by comdisc at 2013-06-18 17:02:03
请推荐一些量化软件，能够模拟丝氨酸变成色氨酸的过程，即底物到产物的变化情况，涉及到键的形成或者断裂。...

收费的gaussian,不收费的orca,gamess等
赞一下 回复此楼
6楼2013-06-18 18:20:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 hxy2011 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 334分 一志愿武理 材料求调剂 +12 李李不服输 2026-03-26 12/600 2026-03-30 10:33 by 我是小康
[考研] 0703一志愿9，初试成绩：338，四六级已过，有科研经历，求调剂！ +5 Zuhui0306 2026-03-25 5/250 2026-03-30 10:27 by herarysara
[考研] 求调剂 +6 家佳佳佳佳佳 2026-03-29 6/300 2026-03-30 06:48 by zhyzzh
[考研] 275求调剂 +15 Micky11223 2026-03-25 20/1000 2026-03-29 20:44 by 唐沐儿
[考研] 化学0703 调剂 306分 一志愿211 +7 26要上岸 2026-03-28 7/350 2026-03-29 20:04 by 无际的草原
[考研] 289求调剂 +5 BrightLL 2026-03-29 5/250 2026-03-29 17:24 by zhyzzh
[考研] 0856材料化工调剂 总分330 +14 zhubinhao 2026-03-27 14/700 2026-03-29 10:01 by Sjndkwm
[考研] 085701环境工程，267求调剂 +16 minht 2026-03-26 16/800 2026-03-28 12:16 by zllcz
[考研] 求调剂推荐 材料 304 +15 荷包蛋hyj 2026-03-26 15/750 2026-03-28 04:13 by fmesaito
[考研] 一志愿上海理工能源动力（085800）310分求调剂 +3 zhangmingc 2026-03-27 4/200 2026-03-27 19:01 by 给你你注意休息
[考研] 07化学280分求调剂 +10 722865 2026-03-23 10/500 2026-03-27 15:51 by Plutoqq
[考研] 279 分 求调剂 +4 睡个好觉_16 2026-03-24 4/200 2026-03-27 15:05 by 醉在风里
[考研] 材料调剂 +8 匹克i 2026-03-23 8/400 2026-03-27 08:11 by hypershenger
[考研] 化学调剂一志愿上海交通大学336分-本科上海211 +4 小鱼爱有机 2026-03-25 4/200 2026-03-26 10:19 by aa331100
[考研] 一志愿哈工大，085400，320，求调剂 +4 gdlf9999 2026-03-24 4/200 2026-03-25 23:01 by boxking200
[考研] 303求调剂 +6 蓝山月 2026-03-25 6/300 2026-03-25 22:47 by 418490947
[考研] 求调剂 +3 李李不服输 2026-03-25 3/150 2026-03-25 13:03 by cmz0325
[考研] 求调剂 +6 研研，接电话 2026-03-24 7/350 2026-03-24 17:01 by barlinike
[考研] 材料考研调剂生 +3 黄粱一梦千年 2026-03-24 3/150 2026-03-24 17:00 by barlinike
[考研] 求老师收我 +3 zzh16938784 2026-03-23 3/150 2026-03-23 12:56 by ztnimte
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭