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souledge

专家顾问 (著名写手)


xueht987: 金币+1, 专家考核, 鼓励交流! 2012-07-14 19:24:28
引用回帖:
10楼: Originally posted by cj4566 at 2012-07-13 12:23:18
嘿嘿  都逆天了阿,看来软件开发的空间还很大嘛。我看到下面文章中的体系也有上千原子啊:
http://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2012/jm/c1jm13605d...

你要知道,这个文章是PWscf的作者写的,虽然不清楚他们研究院所的机器状况,但是至少,在PWscf的用户手册上,他们给出的一个计算命令是:

虽然不清楚具体是仅仅给了个例子还是他们真的能这么计算,但是相信他们那里的计算资源一定不会太差~
至于究竟他们有多少资源,可以问一下goldenfisher~
思想重于技巧,内涵重于表象
11楼2012-07-13 12:34:45
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cj4566

木虫 (正式写手)

引用回帖:
11楼: Originally posted by souledge at 2012-07-13 12:34:45
你要知道,这个文章是PWscf的作者写的,虽然不清楚他们研究院所的机器状况,但是至少,在PWscf的用户手册上,他们给出的一个计算命令是:
2f/2e/941486_1342153940_773.png
虽然不清楚具体是仅仅给了个例子还是他 ...

厉害,pwscf的那些作者赚大了,发好多牛文章。看来我得换个思路了,拼不过他们。
12楼2012-07-13 12:53:13
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frank_zhan

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
xueht987: 金币+1, 鼓励交流! 2012-07-14 19:24:59
xueht987: 应助指数+1 2012-07-14 19:25:04
cj4566: 金币+10 2012-07-16 13:50:52
是内存太小了。cpu少的话只是慢,但是内存小的话是算死。
frank_zhan,zy2zhan@gmail.com
13楼2012-07-14 13:48:57
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cj4566

木虫 (正式写手)

引用回帖:
13楼: Originally posted by frank_zhan at 2012-07-14 13:48:57
是内存太小了。cpu少的话只是慢,但是内存小的话是算死。

谢谢啊
14楼2012-07-16 13:50:12
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yanglina062

银虫 (小有名气)

您好!刚在小木虫看到您也是做染料分子在半导体表面吸附工作的,我的课题也是这个,刚开始学习用QE,希望能和你多交流,我计算的是38个二氧化钛的cluster,但是一直停留在二氧化钛relax这一步,结果很离谱,您能不能帮我看看?谢谢了!这是我的输入文件:

&CONTROL
  calculation  = 'relax',
  prefix       = 'tio2-new-opt',
  pseudo_dir   = '/home/espresso-4.3.2/pseudo-new',
  outdir       = '/scratch/',
  nstep        = 300
  forc_conv_thr= 1.0D-3
  tprnfor      = .TRUE
  etot_conv_thr= 1.0D-4
/
&SYSTEM
  ibrav     = 6,
  celldm(1) = 66.1404,
  celldm(3) = 1.7143
  nat       = 114,
  ntyp      = 2,
  ecutwfc   = 50.D0,
  ecutrho   = 500.D0,
/
&ELECTRONS
  conv_thr    = 1.D-6,
  mixing_beta = 0.7D0,
  electron_maxstep=350,
/
&EE
which_compensation='martyna-tuckerman'
/
&IONS
/
ATOMIC_SPECIES
       O     15.9989995956  O.pbe-van_ak.UPF
      Ti     47.9000015259  Ti.pbe-sp-van_ak.UPF
ATOMIC_POSITIONS {crystal}
。。。。。
K_POINTS {Gamma}

grep total outfile tio2-opt.out
后输出文件表示能量越来越大,从-6000多一直升到-2000,真不知道是怎么回事。
come on!
15楼2012-09-05 14:46:22
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cj4566

木虫 (正式写手)

输入文件看不出啥问题啊,为啥要用cluster啊,周期性不挺好吗?
16楼2012-09-06 05:46:03
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yanglina062

银虫 (小有名气)

引用回帖:
16楼: Originally posted by cj4566 at 2012-09-06 05:46:03
输入文件看不出啥问题啊,为啥要用cluster啊,周期性不挺好吗?

文献上好多不都是cluster么,中科院一老师也说cluster比较好,可是我就是弄不了,你能不能帮我发个你计算成功的例子,周期性的也行,我学习一下,谢谢了!我的邮箱是3120110540@bit.edu.cn
come on!
17楼2012-09-06 14:13:10
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