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yezh

银虫 (小有名气)

[交流] 六氨合钌的信号问题已有2人参与

一般都是利用钌与DNA的磷酸骨架结合,为什么没怎么见到利用这种电荷吸附检测蛋白呢?
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电池小兵

铁杆木虫 (著名写手)

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seagrove: 金币+5, ECEPI+1, 应助详细,奖励! 2012-07-15 17:06:52
一般都是利用钌与DNA的磷酸骨架结合,为什么没怎么见到利用这种电荷吸附检测蛋白呢?

1、DNA与电活性小分子之间的作用模式一般分为三类(见图1):(1)电活性小分子与DNA带负电荷的核糖一磷酸基骨架之间产生静电作用;(2)电活性小分子与DNA的沟槽相互作用;(3) 电活性小分子嵌人DNA分子双螺旋的碱基之间作用。
LZ说的应该是属于第一类作用模式

2、DNA是一条含磷酸酯键的长链聚阴离子,故能够与很多电活性金属阳离子作用。在DNA的电化学研究中,与DNA作用电化学活性小分子有简单金属离子,过渡金属配合物和有机小分子。简单金属离子与DNA作用的研究工作比较少,最常用的是过渡金属配合物和有机小分子。如LZ说的六氨合钌Ru(NH3) 62+、以及Ru(bpy) 32+、Os(bpy) 32+都是常用的电化学探针。

3、“为什么没怎么见到利用这种电荷吸附检测蛋白呢?”
   蛋白质的基本结构单位是 α-氨基酸, 组成蛋白质的氨基酸有二十多种.二十种    基本氨基酸按 R基团的极性划分:  非极性基团、 不带电荷的极性基团、 带电荷的极性基团。其中带负电荷的两种:(酸性氨基酸),包括 天冬氨酸、谷氨酸。 带正电荷的三种:(碱性氨基酸), 赖氨酸、精氨酸、组氨酸氨酸。
    蛋白质一般是由多肽组成的大分子化合物,其中包含正电荷和负电荷基团,如果仅采用电活性小分子(如六氨合钌)与蛋白质的静电作用来做检测,是很难达到检测目的的。蛋白质在水溶液中有一个pKa值,我们可以通过调节溶液的pH值来使蛋白质带净的正电荷或者带净的负电荷,但是这任然避免不了局部的相反电荷。例如,某蛋白质在pH5溶液带净正电荷,但其局部也是带负电荷的。
     综上,不能用上述静电作用来检测蛋白质。

希望小兵的回帖对你有所帮助。

图1 DNA与电活性小分子之间的三种作用模式。

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2楼2012-07-15 16:47:19
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电池小兵

铁杆木虫 (著名写手)


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引用回帖:
2楼: Originally posted by 电池小兵 at 2012-07-15 16:47:19
一般都是利用钌与DNA的磷酸骨架结合,为什么没怎么见到利用这种电荷吸附检测蛋白呢?

1、DNA与电活性小分子之间的作用模式一般分为三类(见图1):(1)电活性小分子与DNA带负电荷的核糖一磷酸基骨架之间产生静电作 ...

补充一下:简单而言,DNA的整条的核糖一磷酸基骨架的都是带负电荷的,而蛋白质则不是(具体解释见上贴),因此不能用简单的静电吸附来检测蛋白质。
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3楼2012-07-15 16:51:31
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yezh

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 电池小兵 at 2012-07-15 16:47:19
一般都是利用钌与DNA的磷酸骨架结合,为什么没怎么见到利用这种电荷吸附检测蛋白呢?

1、DNA与电活性小分子之间的作用模式一般分为三类(见图1):(1)电活性小分子与DNA带负电荷的核糖一磷酸基骨架之间产生静电作 ...

谢谢你精彩的回答!我可否理解为测量蛋白质不是通用方法,毕竟局部带电情况与PH相关,另外也不一定能和电极表面发生电子传递
4楼2012-07-18 10:40:22
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姚舒愉

新虫 (初入文坛)


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请问你的六氨和钌在哪里买的啊?
5楼2016-03-02 16:00:31
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