| 查看: 1124 | 回复: 3 | |||
flymice金虫 (著名写手)
|
[求助]
关于高分子链的建模
|
|
求问，我想建立关于pvdf分子的模型。我已经知道pvdf的晶体结构，在建完晶体结构之后，由于计算能力有限，只能从中取出一段包含8各原子的链。这个时候如果使用两端自动加氢的功能，原来原子的位置也会发生改变；不使用那个功能的话，又不知道应该怎么样把氢原子加上去，求问高手，这个时候应当怎么办？谢谢了。 附图如下： 说明，白色的是H原子，黑色的是C原子，其余是F原子。  这是从晶体结构里面得来的结构，很明显，同一侧的F原子不在一条直线上，同一侧H原子也不在一条直线上。  加氢后，除了最前端的H原子，后面的同一侧H原子都在一条直线上  使用clean功能后，同一侧H原子及F原子都在一条直线上，与原来结构差别颇大。 求问此时该当如何是好？ |
回复此楼» 本帖已获得的红花（最新10朵）
看谁还有» 猜你喜欢
上海工程技术大学【激光智能制造】课题组招收硕士
已经有6人回复
-
带资进组求博导收留
已经有11人回复
-
自荐读博
已经有5人回复
-
求个博导看看
已经有16人回复
-
上海工程技术大学张培磊教授团队招收博士生
已经有4人回复
-
求助院士们，这个如何合成呀
已经有4人回复
-
临港实验室与上科大联培博士招生1名
已经有9人回复
-
写了一篇“相变储能技术在冷库中应用”的论文，论文内容以实验为主，投什么期刊合适？
已经有6人回复
-
最近几年招的学生写论文不引自己组发的文章
已经有11人回复
-
中科院杭州医学所招收博士生一名（生物分析化学、药物递送）
已经有3人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Tg以下分子链段是不能运动，这句话是错的，谁能解释下
已经有34人回复
- 据说PEG高分子链和聚丙烯酸高分子链有氢键相互作用，会导致沉淀发生，是这样的吗？
已经有6人回复
- 关于应力松弛-链段的伸展与回复
已经有15人回复
- 在高分子链中引入苯环有什么用啊
已经有6人回复
- 【交流】2010年杰青名单出炉，看看你老板在不在
已经有41人回复
- 【求助】关于高分子链的Rouse模型和Reptation模型
已经有7人回复
uuv2010
荣誉版主 (职业作家)
- 1ST强帖: 6
- 应助: 160 (高中生)
- 贵宾: 3.14
- 金币: 3679.7
- 散金: 5802
- 红花: 79
- 沙发: 35
- 帖子: 4560
- 在线: 915.2小时
- 虫号: 966216
- 注册: 2010-03-09
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
- 管辖: 第一性原理
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2012-07-02 21:17:20
flymice: 金币+30, ★★★很有帮助, 谢谢诶。 2012-07-14 10:16:47
flymice: 金币+20, ★有帮助, 无其余答案，全部送给你吧。 2012-08-17 13:45:04
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2012-07-02 21:17:20
flymice: 金币+30, ★★★很有帮助, 谢谢诶。 2012-07-14 10:16:47
flymice: 金币+20, ★有帮助, 无其余答案，全部送给你吧。 2012-08-17 13:45:04
|
如果想手动添加原子的话，可以直接add atoms，然后填入想要添加原子的坐标（也就是图中的氢原子）； 另外一种办法是直接用画笔添加，然后调整键长键角到所需要的位置 需要说明的是：这样建立的结构都是错略的初始构型，计算中需要优化，性质的计算都需要采用优化后的构型 |
2楼2012-07-02 20:12:08
3楼2019-04-05 20:26:09
|
本帖内容被屏蔽 |
4楼2020-03-29 20:51:20