24小时热门版块排行榜    

查看: 1141  |  回复: 3
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

大风吹

银虫 (小有名气)

[求助] 文献所示启动子区共有结合序列 T K R Y什么意思

如题所示
在文献中查某一转录因子结合位点时,会给出TRKKTRY 有的还含有W或者N,这些字母均不是ATGC代表什么意思啊,感觉像是某一种偏好性,到底是代表什么呢?
哪位大侠解释一下
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

西瓜

荣誉版主 (知名作家)

貌似是Foxa转录因子的结合位点?TRKKTRY这些字母,每一个都是代表了多个核苷酸,你可以看看上面的表。
3楼2012-06-28 17:27:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

西瓜

荣誉版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking: 金币+4, 鼓励发帖帮助解答问题。 2012-06-28 20:08:03
大风吹: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2012-06-29 12:32:25
IUPAC ambiguity codes are single-letter codes for nucleotides and amino acids established by the International Union of Pure and Applied Chemistry. This nomenclature is used for specifying Pattern Search parameters.

Nucleotides (Cornish-Bowden, 1985):

Symbol        Meaning
G        G
A        A
T        T or U
C        C
U        U or T
R        G or A
Y        T, U or C
M        A or C
K        G, T or U
S        G or C
W        A, T or U
H        A, C, T or U
B        G, T, U or C
V        G, C or A
D        G, A, T or U
N        G, A, T, U or C
Amino Acids:

1-Letter Symbol        3-Letter Symbol        Meaning
A        Ala        Alanine        
R        Arg        Arginine        
N        Asn        Asparagine        
D        Asp        Aspartic acid        
C        Cys        Cysteine        
Q        Gln        Glutamine        
E        Glu        Glutamic acid        
G        Gly        Glycine        
H        His        Histidine        
I        Ile        Isoleucine        
L        Leu        Leucine        
K        Lys        Lysine        
M        Met        Methionine        
F        Phe        Phenylalanine        
P        Pro        Proline        
S        Ser        Serine        
T        Thr        Threonine        
W        Trp        Tryptophan        
Y        Tyr        Tyrosine        
V        Val        Valine               
B        Asx        Asparagine or Aspartic acid
Z        Glx        Glutamine or Glutamic acid
X        ???        Unknown        
Cornish-Bowden, A. (1985). Nomenclature for incompletely specified bases in nucleic acid sequences: recommendations 1984. Nuc. Acids Res. 13:3021-3030.
2楼2012-06-28 17:24:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sk_yb

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
楼上正解,比如R代表嘌呤。两个都有可能
4楼2012-06-28 20:09:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 博后网上办公系统维护 +13 取名字烦人 2024-06-25 21/1050 2024-06-26 19:41 by msjy
[有机交流] 大佬们,打的核磁氢谱与chemdraw预测的有偏差 +5 来了个 2024-06-26 5/250 2024-06-26 17:28 by Jasonlin7758
[考研] 刚当完兵回来想考研 +7 五官在线 2024-06-23 18/900 2024-06-26 17:05 by 1158057902
[论文投稿] 我在写关于多维空间的论文,希望能与大家交流,准备在science上发表 +8 lgf519 2024-06-24 10/500 2024-06-26 16:25 by 梦渺岚烟
[基金申请] 博后面上今天下午会公布吗?有无消息? +26 hajkdfdf 2024-06-24 43/2150 2024-06-26 16:04 by kyukitu
[基金申请] 博后面上和特助今天出吗? +41 逗您玩 2024-06-21 78/3900 2024-06-26 16:00 by HAPPY_0225
[育儿交流] 暑假孩子一个人在家可以干什么 +4 唠叨的映 2024-06-25 5/250 2024-06-26 15:35 by 361997417
[基金申请] 省基金对国自然申请是有利还是有弊 +6 zycumt04 2024-06-26 7/350 2024-06-26 15:02 by 潇湘之迷
[硕博家园] 难道我真的要放弃吗? +42 133456 2024-06-20 44/2200 2024-06-26 12:32 by lyfbangong
[基金申请] 评审专家会不会很在意申请人的单位啊 +11 lancet0903 2024-06-24 13/650 2024-06-26 11:42 by 漠上藜梭
[有机交流] 酚羟基甲基化 10+4 A好运来啦啦啦 2024-06-25 6/300 2024-06-26 10:08 by 88817753
[有机交流] 对苯乙烯磺酰氯的合成机理 25+3 该死的科研 2024-06-24 5/250 2024-06-25 17:30 by 王学士
[硕博家园] 数据不好 +5 Hetai 2024-06-23 7/350 2024-06-25 12:37 by 1591099
[教师之家] 复旦夏同学提出高校成年人学生退学不应该让家长审核,大家认同吗? +10 苏东坡二世 2024-06-22 17/850 2024-06-24 16:52 by wanghuawei
[金属] EBSD的解析率只有10% +3 wallace6666 2024-06-20 7/350 2024-06-24 16:52 by wallace6666
[基金申请] 国自然青年基金,1A4B能上会吗?青年和面上的上会标准是一样的吗? +19 今晚推荐22 2024-06-20 32/1600 2024-06-23 23:17 by andywei1028
[论文投稿] OSA期刊审稿逾期 +3 Thomas_Squid 2024-06-22 3/150 2024-06-23 15:20 by wspglt
[基金申请] 工材口青年基金上会可能性 +10 今晚推荐22 2024-06-19 13/650 2024-06-23 15:11 by Pickfoot
[有机交流] 求助 45+7 脂质纳米粒 2024-06-20 9/450 2024-06-23 07:52 by buhui7829
[基金申请] 听大佬说今年信息口本子数量大幅增加? +8 wutzxt 2024-06-21 9/450 2024-06-21 19:58 by wutzxt
信息提示
请填处理意见