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palading2006

金虫 (小有名气)

[求助] 如何建立3D化学结构数据库

新手求问,做中药虚拟筛选,现已用chem3D将各种活性化学成分转换成3D结构,但是如何将这些3D结构整合到一个数据库,用于下一步的搜索呢?求推荐什么软件比较好?
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chaizhm

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-06-28 09:45:22
可以用chem3d画图啊,然后保存成你想要的格式,以后就可以直接调用了
壁立万仞,无欲则刚
2楼2012-06-27 21:17:12
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palading2006

金虫 (小有名气)

谢谢战友chaizhm。但是我还是有疑问,每一个分子就有一个图,我一共画了500多个化学结构图。难道这些图就不能归拢到一个数据库中,下一步搜索的时候就可以从这个数据库中搜索比对吗?直接调用的话,那就是一个一个单独比对啊,这样多个活性分子之间的比较无法体现。希望能得到你的解答。谢谢
3楼2012-06-28 07:19:33
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blue_cat

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-06-28 09:07:04
palading2006: 金币+2 2012-06-28 14:22:01
可以的,做成一个sdf文件
DS
4楼2012-06-28 08:14:26
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palading2006

金虫 (小有名气)

谢谢战友blue_cat 。我先去练习练习看看,等有问题再来请教
5楼2012-06-28 09:36:30
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palading2006

金虫 (小有名气)

楼上战友blue_cat,我刚刚试用了将chem3D 将结构保存成SDF格式,但是电脑反馈说有“is not a native CS chemdraw file. Some aspects of your drawing might not be saved accurately. Continue saving anyway?” 这做如何解释啊?问题出在哪方面啊?谢谢
6楼2012-06-28 14:26:08
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