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palading2006

金虫 (小有名气)

[求助] 如何建立3D化学结构数据库

新手求问，做中药虚拟筛选，现已用chem3D将各种活性化学成分转换成3D结构，但是如何将这些3D结构整合到一个数据库，用于下一步的搜索呢？求推荐什么软件比较好？
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1楼 2012-06-27 14:35:15
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chaizhm

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-06-28 09:45:22
可以用chem3d画图啊，然后保存成你想要的格式，以后就可以直接调用了
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壁立万仞，无欲则刚
2楼2012-06-27 21:17:12
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palading2006

金虫 (小有名气)
谢谢战友chaizhm。但是我还是有疑问，每一个分子就有一个图，我一共画了500多个化学结构图。难道这些图就不能归拢到一个数据库中，下一步搜索的时候就可以从这个数据库中搜索比对吗？直接调用的话，那就是一个一个单独比对啊，这样多个活性分子之间的比较无法体现。希望能得到你的解答。谢谢
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3楼2012-06-28 07:19:33
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blue_cat

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-06-28 09:07:04
palading2006: 金币+2 2012-06-28 14:22:01
可以的，做成一个sdf文件
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DS
4楼2012-06-28 08:14:26
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palading2006

金虫 (小有名气)
谢谢战友blue_cat 。我先去练习练习看看，等有问题再来请教
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5楼2012-06-28 09:36:30
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palading2006

金虫 (小有名气)
楼上战友blue_cat，我刚刚试用了将chem3D 将结构保存成SDF格式，但是电脑反馈说有“is not a native CS chemdraw file. Some aspects of your drawing might not be saved accurately. Continue saving anyway?” 这做如何解释啊？问题出在哪方面啊？谢谢
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6楼2012-06-28 14:26:08
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