24小时热门版块排行榜    

查看: 1860  |  回复: 7

dreamyeye

木虫 (著名写手)

[求助] 溶剂化效应输出结果求助

命令行如下:
#p bp86/gen opt=tight freq=noraman scf(tight) SCRF=(PCM,Solvent=C6H6,r
ead)
输出结果并没有
Variational PCM results
=======================
                     (a.u.) =    -399.104877
                     (a.u.) =    -399.126338
Total free energy in solution:
  with all non electrostatic terms            (a.u.) =    -399.114839
--------------------------------------------------------------------
(Polarized solute)-Solvent               (kcal/mol) =     -13.47
--------------------------------------------------------------------
Cavitation energy                        (kcal/mol) =      18.95
Dispersion energy                        (kcal/mol) =     -12.91
Repulsion energy                         (kcal/mol) =       1.17
Total non electrostatic                  (kcal/mol) =       7.22
--------------------------------------------------------------------
Partition over spheres:
Sphere  on Atom  Surface  Charge   GEl     GCav    GDR
    1      N1      14.71  -0.106   -3.05    2.51   -1.52
    2      C4      27.03  -0.023   -0.32    3.28   -2.30
    3      C7      24.01  -0.039   -0.52    3.47   -2.07
    4      O10     19.37   0.053   -6.10    2.53   -1.82
    5      C12     12.00  -0.109   -0.90    1.91   -1.10
    6      O13     18.00   0.100   -0.52    2.61   -1.56
    7      O14     15.46   0.084   -0.48    2.65   -1.38
Added spheres:    24.76   0.019   -1.57    0.00    0.00
--------------------------------------------------------------------
这部分内容,请问各位大侠,如何才能让这部分内容出现呢?
P.S.用的是Gaussian09

[ Last edited by dreamyeye on 2012-6-23 at 10:56 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

周帅happy

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

gaussian说明上有详细的说明,仔细看看。
活到老,学到老
2楼2012-06-28 10:07:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dreamyeye

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 周帅happy at 2012-06-28 10:07:33
gaussian说明上有详细的说明,仔细看看。

似乎09版没有这些输出结果了是吗?说明书看得不是很明白,只是看到它说,所有的项都包括在最后的结果里。
3楼2012-06-28 20:54:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qj1989630

银虫 (小有名气)

你好,请问你用过dmol做过溶剂化效应吗?我现在想做相关的,请教中~
4楼2012-07-11 15:49:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dreamyeye

木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by qj1989630 at 2012-07-11 15:49:38
你好,请问你用过dmol做过溶剂化效应吗?我现在想做相关的,请教中~

我之前从未接触过溶剂化效应啊,这次审稿人要求的,我才开始看看
5楼2012-07-11 20:04:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangth0921

铁虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
dreamyeye: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢啦! 2012-07-12 10:13:28
溶剂化Gibbs能= -13.47 + 7.22 = -6.25 kcal/mol.

根据Gaussian 09的说明书,G09采用了一个更有效的SMD模型,加入DoVacuum和ExternlIteration后输出与G03相似:
SCRF(Solvent=Water,PCM,SMD,DoVacuum,ExternalIteration)
6楼2012-07-11 20:15:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qj1989630

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by wangth0921 at 2012-07-11 20:15:32
溶剂化Gibbs能= -13.47 + 7.22 = -6.25 kcal/mol.

根据Gaussian 09的说明书,G09采用了一个更有效的SMD模型,加入DoVacuum和ExternlIteration后输出与G03相似:
SCRF(Solvent=Water,PCM,SMD,DoVacuum,ExternalI ...

请问 你用过dmol做过溶剂化效应吗?我现在想做相关的,请教中~
7楼2012-07-13 11:52:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangth0921

铁虫 (职业作家)

引用回帖:
7楼: Originally posted by qj1989630 at 2012-07-13 11:52:31
请问 你用过dmol做过溶剂化效应吗?我现在想做相关的,请教中~...

dmol只听过,没见过。
8楼2012-07-13 15:15:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 dreamyeye 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 5/250 2026-11-12 02:45 by 9fOTqj074tIg
[教师之家] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 czAiolzR0IJC 2026-11-10 5/250 2026-11-12 02:09 by 9fOTqj074tIg
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 czAiolzR0IJC 2026-11-10 6/300 2026-11-12 02:01 by 9fOTqj074tIg
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 4/200 2026-11-12 01:30 by 9fOTqj074tIg
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 YHiw1gou1Eda 2026-11-10 5/250 2026-11-12 01:17 by 9fOTqj074tIg
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 YHiw1gou1Eda 2026-11-10 6/300 2026-11-12 01:08 by 9fOTqj074tIg
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 FChKX8meu1ds 2026-11-09 7/350 2026-11-12 00:55 by 9fOTqj074tIg
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 FChKX8meu1ds 2026-11-09 8/400 2026-11-12 00:55 by 9fOTqj074tIg
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 FChKX8meu1ds 2026-11-09 9/450 2026-11-12 00:52 by 9fOTqj074tIg
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 FChKX8meu1ds 2026-11-09 10/500 2026-11-12 00:46 by 9fOTqj074tIg
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 8/400 2026-11-12 00:33 by 9fOTqj074tIg
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-11 3/150 2026-11-11 22:51 by 9fOTqj074tIg
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 czAiolzR0IJC 2026-11-10 3/150 2026-11-11 18:26 by TgvkbZZl9tqB
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 4/200 2026-11-11 17:53 by TgvkbZZl9tqB
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 FChKX8meu1ds 2026-11-09 7/350 2026-11-11 17:31 by TgvkbZZl9tqB
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +5 FChKX8meu1ds 2026-11-09 10/500 2026-11-11 17:25 by TgvkbZZl9tqB
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 FChKX8meu1ds 2026-11-09 6/300 2026-11-11 17:09 by TgvkbZZl9tqB
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 7/350 2026-11-11 16:41 by TgvkbZZl9tqB
[文学芳草园] 厉娜 +3 张丹枫1991 2026-11-09 5/250 2026-11-09 16:53 by 张丹枫1991
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-09 00:14 by l48hFd8Nwae2
信息提示
请填处理意见