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liliuping2

木虫 (正式写手)

[求助] 关于质谱测定蛋白质分子量的图谱分析

送蛋白样品出去测质谱,目的是测定分子量,用的是MALDI-TOP质谱仪,标准品与测试样图谱分别如下,回来后就给两个图谱,也木有啥分析,不知道是到底是分子量分析还是酶切后半胱氨酸分析,大家帮忙分析一下这谱图。

标准样



测试样
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cpn

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

lz,这两张MALDI的图其实不太好,你有没注意到,你的第一张谱图处的9千多还出了一个峰,感觉像是做MALDI时激光能量太大,双电荷峰都出来了。
另外,这两张谱图应该是分别累加多张谱图累加出来的吧?一个像大包的峰里有个尖峰突出来,比较奇怪,如果是多张谱图累加出来的,也就不奇怪了,MALDI存在结晶不均匀的问题,在不同的点打出来的图可能会略有差别。
其实你更应该关注,你的峰宽都有1500Da了,分子量标出来差个几百Da,也不是不可能的事。
你可以把两张图stack比对看看。
13楼2012-08-09 12:48:23
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dshlove

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking: 金币+3, 鼓励发帖交流问题。 2012-06-20 20:37:19
你先对照你的蛋白分子量看看啊,我看不像是酶切之后的,倒像是直接给你样品分析的,不知道你的样品纯度如何?
2楼2012-06-20 17:03:45
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liliuping2

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by dshlove at 2012-06-20 17:03:45
你先对照你的蛋白分子量看看啊,我看不像是酶切之后的,倒像是直接给你样品分析的,不知道你的样品纯度如何?

样品WM大概在20kda左右,纯度可以达到90%的,我是想把这两个图放论文中,可是也不知道怎么讨论,只能说由于仪器误差导致的测试误差
3楼2012-06-20 20:02:05
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月月大可

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
呵呵,有点意思啊。我还不清楚这种仪器电离化的方法,但是你说了分子量是20kd,现在结果是20445,说明就是单电荷的。    我的理解标准品是用来给你分析误差的,表明是已知分子量,现在测试,你就能算出误差率。 然后将该误差率应用到你的样品上。你还的找他们要标准品是什么,分子量是多少。 然后查询该仪器电离化的方法,确定如果是单电荷,那就是数字是多少分子量就是多少!
4楼2012-06-20 21:42:54
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