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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 引物设计好了怎么检测它的特异性
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欢仔

银虫 (正式写手)

[求助] 引物设计好了怎么检测它的特异性

大家好我的引物用primer 设计好了  ，现在我不知道该怎么判断它的好坏，给点建议吧
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勇于尝试新鲜事物
1楼 2012-06-19 12:37:39
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欢仔

银虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 西瓜 at 2012-06-20 17:59:00
到Primer Blast上blast一下，看看有没有结合目的基因之外的东西就好啦。如果有，那就看看是不是你那个物种的，不是就ok啦。
参数虽多，不过很好懂的，建议你耐心看看哈

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tool ...

如果是同一个物种 但是片段和目的片段相差很多 是不是也算特异性好
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勇于尝试新鲜事物
7楼2012-06-21 09:27:53
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yuzhiming

捐助贵宾 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-06-19 13:53:40
欢仔: 金币+2, ★★★很有帮助, 非常感谢 2012-06-20 12:14:22
上游引物nnnnnn下游引物
到NCBI中blast比对。
如果只在你的物种的目的基因里面有特异的序列对应，那么就是特异的引物。
否则，就不是。
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2楼2012-06-19 12:40:34
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欢仔

银虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yuzhiming at 2012-06-19 12:40:34
上游引物nnnnnn下游引物
到NCBI中blast比对。
如果只在你的物种的目的基因里面有特异的序列对应，那么就是特异的引物。
否则，就不是。

我比对过但是出来的结果不太理解
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勇于尝试新鲜事物
3楼2012-06-20 12:14:11
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
欢仔: 金币+2, ★★★很有帮助, 谢谢 2012-06-21 01:09:14
到Primer Blast上blast一下，看看有没有结合目的基因之外的东西就好啦。如果有，那就看看是不是你那个物种的，不是就ok啦。
参数虽多，不过很好懂的，建议你耐心看看哈

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tool ... ?LINK_LOC=BlastHome
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4楼2012-06-20 17:59:00
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