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关于cygwin
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由于进行autodock运行 key.dpf文件有： cygwin warning: MS-DOS style path detected: C:\Users\Administrator.PC-20110120XHRG\key.dpf Preferred POSIX equivalent is: /cygdrive/c/Users/Administrator.PC-20110120XHRG/key.dpf CYGWIN environment variable option "nodosfilewarning" turns off this warning. Consult the user's guide for more details about POSIX paths: http://cygwin.com/cygwin-ug-net/using.html#using-pathnames 因为很诧异，怎么可能有C盘盘符出现在cygwin文件夹后面的路径呢？所以去那个里面建议的网址里大概看了一眼cygwin以及POSIX path是个啥，但是太难懂了，也就看了几句话就放弃了~根据我自己的瞎理解大概认为安了cygwin之后，如果运行这个，就好像这个才是电脑的系统，所以路径是从cygwin之后才开始选择路径的~ 不过我在运行autodock vina的时候还尝试用了一下cygwin，就是/cygdrive/c/Program\ Files/The\ Scripps\ Research\ Institute/Vina/vina --help 的确跟cmd输入 “\Program Files\The Scripps Research Institute\Vina\Vina.exe” --help 得到的结果是一样的，不过由于我实在是不熟悉输入命令这种东西，没办法在cygwin里找到我存放ligand.pdbqt, protein.pdbqt, con.txt 文件的文件夹 也就是C:\Users\Administrator.PC-20110120XHRG\Documents\vina_tutorial 所以最终还是放弃了，乖乖用cmd完成了autodock vina 不过鉴于autodock遇到了这样的warning，所以在想，是不是dock的时候选择路径怎样设置一下就可以不出现这个warning了呢？但是也不可能像平时浏览选择文件那样Browse直接就找到/cygdrive/c/Users/Administrator.PC-20110120XHRG/这个文件夹啊~ 好吧，我太絮叨了， 归纳一下就是俩问题 1. 怎样在cygwin里更改文件路径到命令应该咋输入？？（以C:\Users\Administrator.PC-20110120XHRG\Documents\vina_tutorial”这个路径为例） 2. 怎样解决一直存在的warning 关于autodock里的路径 Preferred POSIX equivalent is: /cygdrive/c/Users/Administrator.PC-20110120XHRG/key.dpf 这个问题？ |
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3楼2012-06-19 09:42:32
veryman
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