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Multiwfn和Gaussian计算体积的差别在哪里？ 已有1人参与
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| 之前都是用Gaussian的volume计算分子的体积，一般取100次计算值的平均值，因此消耗的时间比较长。昨天发现用Multiwfn的100号功能的第3项也能计算体积，这个就快多了，计算100次几乎可以在几分钟内完成。用两种方法算出的体积也很接近，所以想问一下，这两种方法的差别在哪里？为何高斯算起来如此耗时？ |
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sobereva
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gmy1990: 金币+3 2012-06-16 15:34:50
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gmy1990: 金币+3 2012-06-16 15:34:50
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原理见此贴的讨论 http://hi.baidu.com/sobereva/blo ... b51c3406088b44.html Multiwfn比Gaussian计算体积更快有几个因素：1 可能你用的是范德华球叠加的定义而不是bader的定义 2 可能MC（蒙特卡罗）过程中计算的点数不一样 3 Multiwfn自身代码效率高。此程序在计算电子密度方面做过充分优化，而且计算范德华体积模块是并行化的。 另外，Multiwfn还有一种计算体积的方式，就是通过主功能12（定量分子表面分析）来计算，在输出分子表面信息的同时也会一起把体积信息输出出来，这就是bader定义的体积，但是用的不是MC方法计算，而是用改进的marching tetrahedron算法。 |
2楼2012-06-16 15:08:14