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alan8410木虫 (正式写手)
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[求助]
求助，编译Nwchem 总一在一个地方出错：DMatrix-mpi.F
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ifort -c -i8 -align -w -g -vec-report1 -O3 -prefetch -unroll -tpp7 -ip -xP -no-prec-div -I. -I/share/home/XX/sourcecode/openmpi/include -I/share/home/XX/sourcecode/nwchem-6.1/src/include -I/share/home/XX/sourcecode/nwchem-6.1/src/tools/install/include -DEXT_INT -DLINUX -DLINUX64 -DIFCV8 -DIFCLINUX -DPARALLEL_DIAG -DMPI DMatrix.F ifort -c -i8 -align -w -g -vec-report1 -O3 -prefetch -unroll -tpp7 -ip -xP -no-prec-div -I. -I/share/home/sci_029/sourcecode/openmpi/include -I/share/home/XX/sourcecode/nwchem-6.1/src/include -I/share/home/XX/sourcecode/nwchem-6.1/src/tools/install/include -DEXT_INT -DLINUX -DLINUX64 -DIFCV8 -DIFCLINUX -DPARALLEL_DIAG -DMPI DMatrix-mpi.F DMatrix-mpi.F(1363): error #6404: This name does not have a type, and must have an explicit type. [STUPID_MSGLEN] stupid_msglen = 7*7 ------^ DMatrix-mpi.F(1365): error #6404: This name does not have a type, and must have an explicit type. [STUPID_DOUBLE] > stupid_double,stupid_sum, 有没有虫友遇到这个问题？ 用的mpi是mpich, openmpi, 都通不过！ 是在北京计算中心编译的，有没有朋友在上面编译成功的？ setenv USE_MPI y #setenv USE_MPIF y setenv MPI_LOC /share/home/sci_029/sourcecode/openmpi setenv MPI_LIB $MPI_LOC/lib setenv MPI_INCLUDE $MPI_LOC/include setenv LIBMPI "-lmpi" mpi部分脚本如上. 编译器，ifort icc setenv FOPTIMIZE "-O3 -xSSE2,SSE3,SSSE3,SSE4.1,SSE4.2 -no-prec-div -funroll-loops -multiple-processes=8 -unroll-aggressive" setenv COPTIMIZE "-O3 -xSSE2,SSE3,SSSE3,SSE4.1,SSE4.2 -no-prec-div -funroll-loops" #make FC=ifort CC=icc nwchem_config #setenv FC /public/software/mpich2-1.0.7/bin/mpif77 #setenv CC /public/software/mpich2-1.0.7/bin/mpicc make FC=ifort CC=icc [ Last edited by alan8410 on 2012-6-11 at 12:29 ] |
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在自己电脑上弄过，帖一个自己的笔记 服务器架构x86_64，用户：gmy mpi版本：mpich2-1.1.1p1 编译步骤： 1， 更改环境变量 vi .bashrc 加上如下内容 export LARGE_FILES=TRUE export LIB_DEFINES="-DDFLT_TOT_MEM=16777216" export USE_MPI=y export MPI_LOC=/public/home/gmy/mpich2-install/ export MPI_LIB=$MPI_LOC/lib export MPI_INCLUDE=$MPI_LOC/include export LIBMPI="-lmpich" export NWCHEM_TOP=/public/home/gmy/nwchem-6.1 export NWCHEM_TARGET=LINUX64 export NWCHEM_TARGET_CPU=x86_64 export FC=ifort export CC=gcc export NWCHEM_MODULES=all export PATH=$NWCHEM_TOP/bin/LINUX64:$PATH 2， source .bashrc 3， tar –xvf Nwchem-6.1-2012-Feb-10.tar.gz, 生存nwchem-6.1文件夹 4， 进入nwchem-6.1路径下，再进入src子路径，执行命令 make nwchem_config（这个比较快），完了之后再make，大概要半个小时编译时间 5， 编译完之后，做个例子测试cd / nwchem-6.1/examples/qmd 做一个并行任务的计算例子，跑一个小分子水h2o_scf.nw 命令如下 mpirun –np 4 /public/home/gmy/nwchem-6.1/bin/LINUX64_x86_64/nwchem（这个是nwchem运行程序的路径） h2o_scf.nw 正常结束 Total times cpu: 1.6s wall: 16.5s |
2楼2012-06-12 09:31:02
alan8410
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