应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » NAMD求助
51/1返回列表
查看: 751  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

lylyly2006

木虫 (正式写手)

[求助] NAMD求助

帮帮忙分析一些这个图片NAMD运行参数怎么设置啊？我的怎么不能运行啊？
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2012-06-09 14:33:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-06-10 23:01:55
楼上讲的非常有道理。
还有就是你这用的是XP版的NAMD，
../   这个命令时LINUX的 转换目录的命令，在XP下能用吗？

建议你把你的 .conf文件以及输入的坐标文件（PDB PSF），参数文件都考到你的工作目录里面,然后直接使用：

namd2 lee_wb_eq.conf > lee_wb_eq.log
来计算
赞一下 回复此楼
4楼2012-06-10 20:51:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

arthurii

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-06-10 20:45:54
以前碰过这个问题，太久忘记了，你重新按照tutorial有开始重新做一遍看看吧。
赞一下 回复此楼
2楼2012-06-10 19:38:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ghs25372216

禁虫 (正式写手)
★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-06-10 19:56:21
本帖内容被屏蔽
3楼2012-06-10 19:45:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lylyly2006

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-06-10 20:51:43
楼上讲的非常有道理。
还有就是你这用的是XP版的NAMD，
../   这个命令时LINUX的 转换目录的命令，在XP下能用吗？

建议你把你的 .conf文件以及输入的坐标文件（PDB PSF），参数文件都考到你的工作目录里面,然后 ...

把 .conf文件以及输入的坐标文件（PDB PSF），参数文件都考到工作目录里面,然后直接使用：
namd2 lee_wb_eq.conf > lee_wb_eq.log
貌似不行啊！
赞一下 回复此楼
5楼2012-06-12 10:08:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭