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lylyly2006

木虫 (正式写手)

[求助] NAMD求助

帮帮忙分析一些这个图片NAMD运行参数怎么设置啊？我的怎么不能运行啊？
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1楼 2012-06-09 14:33:51
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arthurii

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-06-10 20:45:54
以前碰过这个问题，太久忘记了，你重新按照tutorial有开始重新做一遍看看吧。
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2楼2012-06-10 19:38:28
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ghs25372216

禁虫 (正式写手)
★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-06-10 19:56:21
本帖内容被屏蔽
3楼2012-06-10 19:45:10
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-06-10 23:01:55
楼上讲的非常有道理。
还有就是你这用的是XP版的NAMD，
../   这个命令时LINUX的 转换目录的命令，在XP下能用吗？

建议你把你的 .conf文件以及输入的坐标文件（PDB PSF），参数文件都考到你的工作目录里面,然后直接使用：

namd2 lee_wb_eq.conf > lee_wb_eq.log
来计算
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4楼2012-06-10 20:51:43
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lylyly2006

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-06-10 20:51:43
楼上讲的非常有道理。
还有就是你这用的是XP版的NAMD，
../   这个命令时LINUX的 转换目录的命令，在XP下能用吗？

建议你把你的 .conf文件以及输入的坐标文件（PDB PSF），参数文件都考到你的工作目录里面,然后 ...

把 .conf文件以及输入的坐标文件（PDB PSF），参数文件都考到工作目录里面,然后直接使用：
namd2 lee_wb_eq.conf > lee_wb_eq.log
貌似不行啊！
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5楼2012-06-12 10:08:29
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by lylyly2006 at 2012-06-12 10:08:29
把 .conf文件以及输入的坐标文件（PDB PSF），参数文件都考到工作目录里面,然后直接使用：
namd2 lee_wb_eq.conf > lee_wb_eq.log
貌似不行啊！...

不行？
有啥错误提示？

我的XP版NAMD 就是这么用的，没问题啊？
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6楼2012-06-12 11:27:54
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橙橙0916

金虫 (小有名气)
请问下你这个问题解决了吗，我也遇到同样的问题了哎
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飞跃吧
7楼2014-02-28 11:21:50
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