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AIM计算氢键的八个指标求助 已有1人参与
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| AIM计算氢键有八个指标分别是标准如下所述：(1)正确的拓扑类型 (即存在一个键的临界点(BCP)和一条键径)；(2)在此BCP处适当的电子密度值，约在0.002到0.035 au之间；(3)在此BCP处电子密度的Laplacian值在0.024到0.139 au之间；(4)H和Y原子的相互渗透；(5)氢原子净电荷的增加；(6)氢原子的能量增高；(7)偶极极化的降低；(8)氢原子的原子体积减小。第四个指标是在搞不清楚说是非键半径减去成键半径，成键半径是原子到临界点的距离，那请问非键半径咋办文献是这么说的，非键原子半径则为在此氢键方向上原子与一条等密度线(此处我们取为0.001 au)之间的距离，但实际上怎么操作。盼高手解答！！！ |
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shangwu
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gmy1990: 金币+3 2014-09-14 06:49:27
gmy1990: 金币+3 2014-09-14 06:49:27
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参见此文第12小节 Multiwfn支持的弱相互作用的分析方法概览 http://hi.baidu.com/sobereva/item/932f96260c57eaf951fd8716 以及此文的第六节 使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布 http://hi.baidu.com/sobereva/item/692f9a83d8e9a5c8b071545d |
4楼2014-09-13 23:09:13
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