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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 药学 » 天然药物化学 » 判断相对构型，roesy点强弱能代表距离远近么？
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水水洋子

新虫 (小有名气)

[交流] 判断相对构型，roesy点强弱能代表距离远近么？

我有一个化合物做roesy，判断相邻两个氢相对构型，12和11,12和13都想关，但是12与13相关强，能说12与13是同侧的么？
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1楼 2012-06-04 13:09:25
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lizi7952

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3楼: Originally posted by 水水洋子 at 2012-06-04 15:51:24
对，我就是想说13和12是同一朝向的，因为这个化合物做了CD，但是看不出东西，量太少也不能做单晶，所以很苦恼，之前看见的非常相似的化合物判断构形的时候就是用12和13相关看到的，但是没有说11和12也有相关，但是 ...

有是有，但是这个跟参数设置也有关系的。
其实这个要是其他位置没有手性的话，是不是可以用ecd啊，现在挺热的。12位手性碳连在一个发色团上面，可以通过ecd试试。
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4楼2012-06-04 16:44:13
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chh701

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水水洋子: 金币+1 2012-06-04 21:35:17
对于苯骈呋喃型木脂素，利用J应该就可以定其相对构型，楼主可多看下文献应该有
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5楼2012-06-04 17:29:59
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chh701

金虫 (小有名气)
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水水洋子: 金币+1 2012-06-08 17:19:57
去年发的J.N.P的文献，还是可以用偶合常数再借助NOE来确定其相对构型的。不知道楼主看的哪篇文献？因为我之前也分离出来过这类化合物，同样是借助J及NOE来确定的
CD做的峰不明显，难道是没有做平滑处理？或者可换种溶剂试试
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13楼2012-06-05 16:11:03
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wanglibo66

金虫 (小有名气)
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水水洋子: 金币+1 2012-06-08 17:13:04
noesy确定的也是相对构型，11和12质子是相邻质子，是有耦合的，只要是相邻质子在noesy谱上都能看到相关（noesy谱上包括cosy相关信号），不能由此判断构型。另外，可以通过11和13质子，13质子与其他质子的noesy相关确定相对构型，就算是使用CD法，也是要先确定相对构型的。这是前提。
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14楼2012-06-07 07:48:32
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lizi7952

荣誉版主 (文坛精英)
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水水洋子: 金币+3 2012-06-04 15:51:34
11与12之间太近，这种相关很容易看到的。不能说明这两个氢是一个朝向的。

所以如果你说13和12的氢是一个朝向，勉勉强强也能接受。
但是最好还有其他方法佐证。
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2楼2012-06-04 14:03:55
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水水洋子

新虫 (小有名气)
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2楼: Originally posted by lizi7952 at 2012-06-04 14:03:55
11与12之间太近，这种相关很容易看到的。不能说明这两个氢是一个朝向的。

所以如果你说13和12的氢是一个朝向，勉勉强强也能接受。
但是最好还有其他方法佐证。

对，我就是想说13和12是同一朝向的，因为这个化合物做了CD，但是看不出东西，量太少也不能做单晶，所以很苦恼，之前看见的非常相似的化合物判断构形的时候就是用12和13相关看到的，但是没有说11和12也有相关，但是我觉得是应该有。课题组的小老师也都不敢确定是不是点的大小就跟距离远近有关，所以不知道这个roesy是不是有这么个说法呢。。。
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3楼2012-06-04 15:51:24
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haitee

新虫 (小有名气)
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水水洋子: 金币+1 2012-06-04 21:35:27
我觉得可以说12与13是同侧的。
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6楼2012-06-04 17:41:30
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水水洋子

新虫 (小有名气)
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5楼: Originally posted by chh701 at 2012-06-04 17:29:59
对于苯骈呋喃型木脂素，利用J应该就可以定其相对构型，楼主可多看下文献应该有

这个就已经有文献报道由于顺反式J的差异太小，已经被证明不可靠了。
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7楼2012-06-04 21:35:08
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水水洋子

新虫 (小有名气)
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4楼: Originally posted by lizi7952 at 2012-06-04 16:44:13
有是有，但是这个跟参数设置也有关系的。
其实这个要是其他位置没有手性的话，是不是可以用ecd啊，现在挺热的。12位手性碳连在一个发色团上面，可以通过ecd试试。...

能细讲一下怎么通过ECD？模拟最稳定构想，然后怎么做呢？
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8楼2012-06-04 21:37:00
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yangliguo007

木虫 (著名写手)
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您好，我想问一下“做了CD，看不出东西”，是什么意思？谱图是一条直线还是Cotton效应不明显？
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9楼2012-06-04 22:22:31
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lizi7952

荣誉版主 (文坛精英)
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8楼: Originally posted by 水水洋子 at 2012-06-04 21:37:00
能细讲一下怎么通过ECD？模拟最稳定构想，然后怎么做呢？...

这个交给做计算的人去做了，自己搞不来的吧？找合作伙伴呗。
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10楼2012-06-04 22:51:48
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lizi7952

荣誉版主 (文坛精英)
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水水洋子: 金币+1 2012-06-05 09:09:42
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8楼: Originally posted by 水水洋子 at 2012-06-04 21:37:00
能细讲一下怎么通过ECD？模拟最稳定构想，然后怎么做呢？...

这个交给做计算的人去做了，自己搞不来的吧？找合作伙伴呗。
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11楼2012-06-04 22:52:06
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水水洋子

新虫 (小有名气)
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9楼: Originally posted by yangliguo007 at 2012-06-04 22:22:31
您好，我想问一下“做了CD，看不出东西”，是什么意思？谱图是一条直线还是Cotton效应不明显？

cd没有明显的峰的趋势，只是杂杂的上下起伏的基线，加大浓度后只是基线噪音的幅度增加，依然没有峰
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12楼2012-06-05 09:11:48
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水水洋子

新虫 (小有名气)
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14楼: Originally posted by wanglibo66 at 2012-06-07 07:48:32
noesy确定的也是相对构型，11和12质子是相邻质子，是有耦合的，只要是相邻质子在noesy谱上都能看到相关（noesy谱上包括cosy相关信号），不能由此判断构型。另外，可以通过11和13质子，13质子与其他质子的noesy相关确 ...

是啊，就是想先确定这个相对构型，因为12和13 不是相邻质子，而且点又大，所以觉得可以判断是同侧
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15楼2012-06-08 17:12:58
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水水洋子

新虫 (小有名气)
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13楼: Originally posted by chh701 at 2012-06-05 16:11:03
去年发的J.N.P的文献，还是可以用偶合常数再借助NOE来确定其相对构型的。不知道楼主看的哪篇文献？因为我之前也分离出来过这类化合物，同样是借助J及NOE来确定的
CD做的峰不明显，难道是没有做平滑处理？或者可换种 ...

tetrahedron 62(2006) 12182-12190 这篇文章
相似结构的文献用的是甲醇做的，能看出来。可是我用甲醇就没有，做过平滑处理。
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16楼2012-06-08 17:19:52
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韩华燕

新虫 (初入文坛)
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3楼: Originally posted by 水水洋子 at 2012-06-04 15:51:24
对，我就是想说13和12是同一朝向的，因为这个化合物做了CD，但是看不出东西，量太少也不能做单晶，所以很苦恼，之前看见的非常相似的化合物判断构形的时候就是用12和13相关看到的，但是没有说11和12也有相关，但是 ...

在吗
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17楼2012-06-09 20:32:11
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水水洋子

新虫 (小有名气)
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17楼: Originally posted by 韩华燕 at 2012-06-09 20:32:11
在吗...

恩，在
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18楼2012-06-10 11:14:18
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lizi7952

荣誉版主 (文坛精英)
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
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14楼: Originally posted by wanglibo66 at 2012-06-07 07:48:32
noesy确定的也是相对构型，11和12质子是相邻质子，是有耦合的，只要是相邻质子在noesy谱上都能看到相关（noesy谱上包括cosy相关信号），不能由此判断构型。另外，可以通过11和13质子，13质子与其他质子的noesy相关确 ...

请问一下，像这个图

向这两个氢在noesy能看到相关吗？从空间上，感觉不行啊。
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19楼2012-06-10 12:02:43
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liyuxia~

木虫 (小有名气)
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
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19楼: Originally posted by lizi7952 at 2012-06-10 12:02:43
请问一下，像这个图

向这两个氢在noesy能看到相关吗？从空间上，感觉不行啊。...

当然可以，而且还不弱。想想，虽然在异侧，但为3j，都能耦合了，怎不会出现？个人认为凡能在cosy中相关的质子，在nosey中也相关。有一点需要注意的是：noesy中信号出或不出还跟分子量大小有关，有时候该出的不出，不好判定。
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20楼2015-07-31 21:52:04
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