24小时热门版块排行榜    

查看: 1459  |  回复: 4

cj4566

木虫 (正式写手)

[交流] 请教pwscf计算吸附的问题 已有2人参与

我刚开始学习pwscf,想计算分子在ZnO表面的吸附,跟大家请教一下具体步骤。
我的理解是对ZnO bulk进行relax得到优化后的晶格参数,然后用所得的晶格参数建立表面模型,进行收敛测试,最后加上小分子再进行收敛测试和其他计算。

问题是我对ZnO bulk优化完之后,在.out文件中只看到原子坐标,怎么知道优化后的晶格参数呢?坐标如下,ZnO是六方晶系,P63mc空间群。谢谢了!!!
ATOMIC_POSITIONS (crystal)
O        0.333333333   0.666666667   0.382191656
O       -0.333333333  -0.666666667   0.882191656
Zn       0.333333333   0.666666667   0.000408344
Zn      -0.333333333  -0.666666667   0.500408344
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
WDD880227: 金币+2, 感谢您的指导 2012-05-31 15:20:38
如果是做的relax,那么晶格肯定没变化,只有内部格点位置变化了,所以不用看。
如果是做的vc-relax,晶格会发生变化,这时要看最后一步scf的,也就是这句后的
CODE:
     A final scf calculation at the relaxed structure.
     The G-vectors are recalculated for the final unit cell
     Results may differ from those at the preceding step.

crystal axes部分。
或者如果觉得这里的有效位数太少,可以看这句之前的几行的CELL_PARAMETERS下面的3x3矩阵。
思想重于技巧,内涵重于表象
2楼2012-05-30 12:35:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cj4566

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by souledge at 2012-05-30 12:35:08
如果是做的relax,那么晶格肯定没变化,只有内部格点位置变化了,所以不用看。
如果是做的vc-relax,晶格会发生变化,这时要看最后一步scf的,也就是这句后的

     A final scf calculation at the relaxed str ...

这样啊,谢谢souledge,那对于吸附体系,需不需要做vc-relax呢?您看我上面写的步骤没什么问题吧,谢了!!!
3楼2012-05-30 14:06:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huazhorg

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
WDD880227: 金币+1, 感谢交流提示 2012-05-31 15:20:54
1、你的步骤没有问题。
2、vc-relax完成后,可以用xcrysden软件直接测量优化后的晶格常数,可以看到是有变化的。
4楼2012-05-31 08:31:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cj4566

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by huazhorg at 2012-05-31 08:31:15
1、你的步骤没有问题。
2、vc-relax完成后,可以用xcrysden软件直接测量优化后的晶格常数,可以看到是有变化的。

谢谢了!!!
5楼2012-05-31 12:32:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 cj4566 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 基金啊基金 +3 longfie172 2026-08-20 3/150 2026-08-21 00:04 by wuchongjun
[基金申请] 科研孤儿太难了 +14 我4大白菜 2026-08-20 15/750 2026-08-20 22:33 by 袁向阳007
[基金申请] 让我中一个面上吧! +8 大萍1987 2026-08-20 10/500 2026-08-20 21:48 by 大萍1987
[基金申请] 言之凿凿,明天官网会通知放榜? +15 医学老男孩 2026-08-20 17/850 2026-08-20 20:35 by CaoLG
[基金申请] 时间戳又变了 +12 wuchongjun 2026-08-20 17/850 2026-08-20 20:05 by spzhao
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +21 yaoyewhu2008 2026-08-20 22/1100 2026-08-20 17:03 by yaoyewhu2008
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+3 snowwithsea 2026-08-19 12/600 2026-08-20 15:56 by lfy8008
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +14 kkkl_v 2026-08-19 15/750 2026-08-20 08:21 by sunzitan
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +4 yuleib84 2026-08-19 5/250 2026-08-19 19:52 by hhs666
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +10 wangze12014 2026-08-14 12/600 2026-08-19 16:56 by 苦难博士
[基金申请] 2027广东省杰青 +4 奶牛小黑 2026-08-15 10/500 2026-08-19 11:02 by wanfengnew
[基金申请] 什么时候开奖? +6 CrisMessi 2026-08-18 6/300 2026-08-19 08:06 by Equinoxhua
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 6/300 2026-08-18 15:36 by wwm09
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
信息提示
请填处理意见