| 查看: 775 | 回复: 4 | |||
ts2009木虫 (著名写手)
无业游民
|
[求助]
哪位大侠知道求蛋白质中两两残基之间的距离的软件或是NAMD的脚本可供使用，不胜感激
|
|
所有的距离都要算，例如一共10个残基，1-2,1-3.。。。所有两个残基之间的距离，望高手指点~~~ [ 来自科研家族 生物医药家族 ] [ Last edited by ts2009 on 2012-5-28 at 20:28 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
求调剂
已经有3人回复
-
一志愿北京化工大学，初试成绩350求调剂
已经有14人回复
-
复试调剂
已经有4人回复
-
323分（计算机视觉和大模型项目）能直接上手
已经有3人回复
-
311分 22408 求调剂
已经有3人回复
-
320分人工智能调剂
已经有7人回复
-
一志愿郑大0705求调剂
已经有4人回复
-
0703化学
已经有10人回复
-
301求调剂
已经有10人回复
-
306分材料与化工求调剂
已经有6人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 下载了MATLAB2012可是安装不了。大侠帮帮忙谢谢
已经有13人回复
- 哪位高手能帮忙解释一下这张DSC图谱？
已经有9人回复
- XRD中如何计算残余奥氏体的量？
已经有12人回复
- 在用fluent做仿真模拟时，连续性和哪些因素有关？谢谢各位大侠
已经有8人回复
- 各位大侠，最近有什么好一点通信类的的EI会议？
已经有18人回复
- 蛋白质的鉴定！
已经有9人回复
- 请教各位大侠我这个情况是哪里的问题（如图）
已经有10人回复
- 急求翻译摘要呀，哪位大侠帮帮忙，感激万分，应助后可追加50金币
已经有2人回复
- 面试：需试讲食品安全方面的课件8分钟，请各位大侠帮帮忙有没有这方面的资源，谢谢了
已经有16人回复
- 各位大侠：《山东大学学报》《计算机工程与应用》《微电子学与计算机》哪个比较好？
已经有17人回复
- 请教高手，要用凝固的猪血做蛋白质电泳，怎么提取蛋白质？
已经有4人回复
- 投稿期刊建议！请各位大侠给些意见
已经有25人回复
- 国家蛋白质科学中心（上海）（筹）招聘启事
已经有3人回复
- Ebook__《蛋白质结构预测》中文版
已经有124人回复
- 【专家会诊】bay 讨论namd,gmx处理水溶液,蛋白等MD 模拟;讨论水及水通道
已经有50人回复
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+3, 谢谢~ 2012-05-29 09:14:08
ts2009: 金币+20, ★★★很有帮助 2012-05-29 09:24:42
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+3, 谢谢~ 2012-05-29 09:14:08
ts2009: 金币+20, ★★★很有帮助 2012-05-29 09:24:42
|
这个简单使用gromacs中的g_mindist或者g_dist 自己去看看手册这两个命令的区别 要是两两残基之间的距离，我推荐使用g_mindist 把每个残基单独定义一个group就很容易算了。 要是NAMD 的话，自己去写个tcl脚本也可以实现 [ Last edited by jiaoyixiong on 2012-5-28 at 21:14 ] |
2楼2012-05-28 21:13:27
mlanqiang
木虫之王 (文学泰斗)
蓝博士
- 应助: 3409 (副教授)
- 金币: 55278.8
- 散金: 5498
- 红花: 62
- 帖子: 73916
- 在线: 730.8小时
- 虫号: 302202
- 注册: 2006-12-02
- 性别: GG
- 专业: 胶体与界面化学
3楼2012-05-28 21:48:51
4楼2012-05-28 23:08:30
5楼2012-05-28 23:34:06
