24小时热门版块排行榜    

查看: 2035  |  回复: 1
【悬赏金币】回答本帖问题,作者qi-cheng将赠送您 30 个金币

qi-cheng

铜虫 (小有名气)

[求助] 石墨结构优化失败,大家看这是什么原因?急~~

在对5X5的石墨进行结构优化的过程中,刚计算了几分钟,就因为下列原因失败了~~最近经常出现这样原因的失败~~到底是哪出错了~~~~
下面是outmol文件

     ===============================================================
     Materials Studio DMol^3 version 5.5
     compiled on Sep 22 2010 09:34:15
     ===============================================================

     ===============================================================
     Density Functional Theory Electronic Structure Program
     Copyright (c) 2010, Accelrys Inc. All rights reserved.
     Cite work using this program as:
     B. Delley, J. Chem. Phys. 92,  508  (1990).
     B. Delley, J. Chem. Phys. 113, 7756 (2000).
     DMol^3 is available as part of Materials Studio.
     ===============================================================


DATE:     May 27 14:07:41 2012

Message: License checkout of MS_dmol successful
Message: License checkout of MS_dsolid successful

Basis set is read from file:
C:\PROGRA~1\Accelrys\MATERI~1.5\share\Resources\Quantum\DMol3\BASFILE_v3.5                                                                                                                                                                                      



INCOOR, atomic coordinates in au (for archive):
______________________________________________________________________>8

$cell vectors
              0.00000000000000    0.00000000000000    0.00000000000000
              0.00000000000000    0.00000000000000    0.00000000000000
              0.00000000000000    0.00000000000000    0.00000000000000
$coordinates
C            -0.00295804966365    0.01073985810945   10.14284231809821
C            -0.00296252974176    2.70307494299080   10.14284219849694
C             4.66103358356346    0.01073935166985   10.14284333034629
C             4.66103130797152    2.70307489406367   10.14284247694750
C             9.32502928226696    0.01073773628329   10.14284241660056
C             9.32502811824219    2.70307391510299   10.14284237055534
C            13.98902544386422    0.01073687099499   10.14284188587392
C            13.98902445216956    2.70307333907488   10.14284185940277
C            18.65302135130919    0.01073785531952   10.14284174181842
C            18.65301585195795    2.70307304829468   10.14284209003769
C            -2.33495541887668    4.05058184245581   10.14284169859669
C            -2.33495947144302    6.74291162421434   10.14284329132655
C             2.32903583743761    4.05058220805970   10.14284300394829
C             2.32903522310887    6.74291169901869   10.14284687887085
C             6.99303254185096    4.05058191806562   10.14284674568549
C             6.99303254538009    6.74291112294626   10.14284393826154
C            11.65702738962881    4.05057972003706   10.14284186537525
C            11.65702754711610    6.74290986895788   10.14283923825861
C            16.32102124361379    4.05057871948452   10.14283727125494
C            16.32101813797347    6.74290982202438   10.14283751220949
C            -4.66695363704756    8.09041838158272   10.14284096484501
C            -4.66695700874592   10.78274729908100   10.14284325631673
C            -0.00296061583610    8.09041830781900   10.14284617171499
C            -0.00296146545430   10.78274942146337   10.14284773556688
C             4.66103548309051    8.09041815760468   10.14284465702844
C             4.66103441859288   10.78274746207077   10.14284289616627
C             9.32502998628601    8.09041610338515   10.14284160035061
C             9.32502971565800   10.78274584850041   10.14283676152782
C            13.98902439000535    8.09041578228567   10.14283784478272
C            13.98902162371909   10.78274673414061   10.14284096319473
C            -6.99895054461988   12.13025437689587   10.14284186662834
C            -6.99895351322816   14.82258471226446   10.14284856645336
C            -2.33495752596812   12.13025494711833   10.14285018090920
C            -2.33495778370450   14.82258596609080   10.14284829593499
C             2.32903748823863   12.13025321602564   10.14284451830970
C             2.32903719753290   14.82258388877931   10.14284169865632
C             6.99303321531714   12.13025171370392   10.14283902279185
C             6.99303242470180   14.82258256406325   10.14283857373079
C            11.65702794044600   12.13025280854539   10.14284142399294
C            11.65702539170469   14.82258392367341   10.14284116314760
C            -9.33094742121601   16.17009184050250   10.14284311261204
C            -9.33095050724131   18.86242752912382   10.14284596954098
C            -4.66695501416691   16.17009245919029   10.14284725754458
C            -4.66695630450696   18.86242770379489   10.14284440949439
C            -0.00296050118424   16.17009000314439   10.14284251425070
C            -0.00296203943074   18.86242621801500   10.14284143035122
C             4.66103535585306   16.17008861762124   10.14283836108883
C             4.66103272721223   18.86242434693637   10.14283744591110
C             9.32503056736014   16.17008997159839   10.14283953630906
C             9.32502543344830   18.86242529413993   10.14284156965722
$end
______________________________________________________________________>8


N_atoms =   50     N_atom_types =  1


INPUT_DMOL keywords (for archive):
______________________________________________________________________>8

#Warning: no global confinement specs in BASFILE
                                                                                                                                    <--
# Task parameters                                                                                                                   <--
Calculate                     optimize                                                                                              <--
Opt_energy_convergence        2.0000e-005                                                                                           <--
Opt_gradient_convergence      4.0000e-003 A                                                                                         <--
Opt_displacement_convergence  5.0000e-003 A                                                                                         <--
Opt_iterations                50                                                                                                    <--
Opt_max_displacement          0.3000 A                                                                                              <--
Symmetry                      off                                                                                                   <--
Max_memory                    2048                                                                                                  <--
                                                                                                                                    <--
# Electronic parameters                                                                                                             <--
Spin_polarization             unrestricted                                                                                          <--
Charge                        0                                                                                                     <--
Basis                         dnp                                                                                                   <--
Dftd                          ts                                                                                                    <--
Pseudopotential               none                                                                                                  <--
Functional                    pbe                                                                                                   <--
Aux_density                   octupole                                                                                              <--
Integration_grid              medium                                                                                                <--
Occupation                    thermal 0.0050                                                                                        <--
Cutoff_Global                 3.3000 angstrom                                                                                       <--
Scf_density_convergence       1.0000e-005                                                                                           <--
Scf_charge_mixing             0.2000                                                                                                <--
Scf_spin_mixing               0.5000                                                                                                <--
Scf_iterations                50                                                                                                    <--
Scf_diis                      6 pulay                                                                                               <--
Kpoints                       off                                                                                                   <--
                                                                                                                                    <--
# Print options                                                                                                                     <--
Print                         eigval_last_it                                                                                        <--
                                                                                                                                    <--
# Calculated properties                                                                                                             <--
Frequency_analysis            on                                                                                                    <--
______________________________________________________________________>8


Publications of specific relevance to this calculation:

Density functional:
PBE functional: Perdew Burke Ernzerhof: Phys. Rev. Lett. 77, 3865 (1996)


+---------------------------------------------------+
|                                                   |
|  Using DFT-SEDC - the DFT Semi-Empirical          |
|  Dispersion interaction Correction module         |
|  Copyright (c) 2008 Erik McNellis and Joerg Meyer |
|  Fritz-Haber-Institut der MPG. Distributed under  |
|  the GNU Lesser General Public License (LGPL).    |
|                                                   |
+---------------------------------------------------+

Spin unrestricted calculation


The Generation and Use of Delocalized Internal Coordinates in Geometry optimization;
Baker Kessi Delley: J. Chem. Phys., 105, 192 (1996)
Andzelm Fitzgerald King-Smith: Chem. Phys. Lett., 335, 321 (2001)

Fractional occupations and density functional energies and forces; Weinert Davenport: Phys. Rev. B 45, 13709 (1992)

Fractional occupations, iterative stability:
Delley in; Modern Density Functional Theory vol 2 pg 221 ff (1995),
  Elsevier, Seminario Politzer eds.

Fast Calculation of Electrostatics in Crystals and Large Molecules;
Delley: J. Phys. Chem. 100, 6107 (1996)
Warning: SYMDEC file generation reset to off
Warning: Hessian file is not present for requested vibrational restart.
Calculation is Spin_unrestricted



Lattice:
translation vector [a0]    1    0.000000000    0.000000000    0.000000000
translation vector [a0]    2    0.000000000    0.000000000    0.000000000
translation vector [a0]    3    0.000000000    0.000000000    0.000000000
Cell volume            0.000 a0^3
Warning: at least C1 SYM file should be there for optgeom
Carbon       nbas=  1, z=   6, nrfn=  7, rcut=  6.24, e_ref= -0.057115 Ha
                                  rcore=  0.00  zval=   6.00   6.00
   n=1  L=0  occ= 2.00 e=     -10.005038Ha      -272.2511eV
   n=2  L=0  occ= 2.00 e=      -0.481323Ha       -13.0975eV
   n=2  L=1  occ= 2.00 e=      -0.166893Ha        -4.5414eV
   n=2  L=0  occ= 0.00 e=      -1.482892Ha       -40.3516eV
   n=2  L=1  occ= 0.00 e=      -1.166937Ha       -31.7540eV
   n=3  L=2  occ= 0.00 e=      -2.722144Ha       -74.0733eV
   n=3  L=2  occ= 0.00 e=      -1.385417Ha       -37.6991eV  eliminated

Symmetry orbitals C1                           
    n  norb    representation
    1   700        a   
  total number of valence orbitals:    700

cell charge=              0.000000   active electron number     300.0
(without charge=             300.0 )
electron temperature=     0.005_Ha      0.14_eV     1579._K

Cell specified has vanishing volume
cutrc3, rlaca=     6.23600
fa,ra 1 -Infinity  2.08E+00  2.08E-01  0.00E+00  2.08E+00 -Infinity -1.01E+01<
fa,ra 2 -Infinity  2.08E-01  2.08E-02  0.00E+00  2.08E-01 -Infinity -8.67E+03<
fa,ra 3 -Infinity  2.08E-02  2.08E-03  0.00E+00  2.08E-02 -Infinity -8.66E+06<
fa,ra 4 -Infinity  2.08E-03  2.08E-04  0.00E+00  2.08E-03 -Infinity -8.66E+09<
fa,ra 5 -Infinity  2.08E-04  2.08E-05  0.00E+00  2.08E-04 -Infinity -8.66E+12<
fa,ra 6 -Infinity  2.08E-05  2.08E-06  0.00E+00  2.08E-05 -Infinity -8.66E+15<
fa,ra 7 -Infinity  2.08E-06  2.08E-07  0.00E+00  2.08E-06 -Infinity -8.66E+18<
fa,ra 8 -Infinity  2.08E-07  2.08E-08  0.00E+00  2.08E-07 -Infinity -8.66E+21<
fa,ra 9 -Infinity  2.08E-08  2.08E-09  0.00E+00  2.08E-08 -Infinity -8.66E+24<
fa,ra10 -Infinity  2.08E-09  2.08E-10  0.00E+00  2.08E-09 -Infinity -8.66E+27<
fa,ra11 -Infinity  2.08E-10  2.08E-11  0.00E+00  2.08E-10 -Infinity -8.66E+30<
fa,ra12 -Infinity  2.08E-11  2.08E-12  0.00E+00  2.08E-11 -Infinity -8.66E+33<
fa,ra13 -Infinity  2.08E-12  2.08E-13  0.00E+00  2.08E-12 -Infinity -8.66E+36<
fa,ra14 -Infinity  2.08E-13  2.08E-14  0.00E+00  2.08E-13 -Infinity -8.66E+39<
fa,ra15 -Infinity  2.08E-14  2.08E-15  0.00E+00  2.08E-14 -Infinity -8.66E+42<
fa,ra16 -Infinity  2.08E-15  2.08E-16  0.00E+00  2.08E-15 -Infinity -8.66E+45<
Message: DMol3 job failed
Error: DMol3 exiting
***error in subroutine cutrc3
  error fa, going back to debugging mode: cutrc3
***error in subroutine cutrc3
  error fa, going back to debugging mode: cutrc3
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qq364085265

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流, 2012-12-17 15:52:50
#Warning: no global confinement specs in BASFILE
这个警告是什么意思?怎么解决?
2楼2012-12-16 22:23:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 qi-cheng 的主题更新
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 博三一直没文章怎么办 +23 133456 2024-05-17 34/1700 2024-05-20 09:44 by lizhiweiouc
[硕博家园] 民办高校入职后稳定吗? +12 905452934 2024-05-16 20/1000 2024-05-20 08:41 by Quakerbird
[考博] 【2025 申博】材料或者冶金工程 +3 枫落孤城 2024-05-19 3/150 2024-05-20 06:03 by 明海天涯
[基金申请] bless bless bless bless bless bless +4 chenwenqnig 2024-05-19 4/200 2024-05-19 23:35 by AZURESKY1999
[有机交流] 除DMSO +3 Spiralup 2024-05-15 4/200 2024-05-19 22:03 by 化研迅
[无机/物化] 请问什么溶剂能溶解二氧化锰 (金币+5) +4 这是春天 2024-05-15 4/200 2024-05-19 11:24 by wanghuawei
[考博] 想被211以上高校课题组接收 +8 风起沧澜 2024-05-16 10/500 2024-05-19 06:52 by Guo369
[考博] 海南大学国家级人才田新龙教授团队氢燃料电池与器件方向招收24级博士/助理 (重点支持) +6 Dreammzp 2024-05-17 8/400 2024-05-18 17:45 by 手机用户
[有机交流] 求助在硝基苯上进行F-C反应甲基化的方案 105+3 epj006144 2024-05-14 8/400 2024-05-18 10:17 by zyp0009928
[教师之家] 白天不懂夜的黑,90后青椒与60后老板 +3 zylfront 2024-05-18 4/200 2024-05-18 10:12 by zylfront
[硕博家园] 耐高温垫片求购 +6 Sexyflea 2024-05-16 9/450 2024-05-18 08:31 by nanbeiY
[留学DIY] 求助:医生想润 +7 safrina 2024-05-15 7/350 2024-05-17 18:50 by 卡皮吧啦123
[论文投稿] 投稿成功后又想撤回 +5 otani 2024-05-16 5/250 2024-05-17 16:02 by topedit
[考博] 24应届生寻博导 +3 8139173 2024-05-15 4/200 2024-05-16 21:09 by 不容易456
[分析] 液相色谱基线上移 5+3 江上鸢飞 2024-05-13 3/150 2024-05-16 11:49 by gwmgyp
[教师之家] 加上“青年”两个字,意义就变了 +10 zylfront 2024-05-13 13/650 2024-05-15 23:36 by flasheagle
[硕博家园] 导师这样说到底有没有机会啊……… +7 理科生yes 2024-05-14 14/700 2024-05-15 18:45 by 理科生yes
[基金申请] 有人看了我的科研之友 +9 jurkat.1640 2024-05-14 12/600 2024-05-15 16:04 by arthas_007
[有机交流] 无水硫酸钠除水 50+4 桃桃PXS 2024-05-13 4/200 2024-05-14 17:46 by 小肉干
[考博] 韩国成均馆大学 软物质杂化材料研究室 Koo Chong Min 教授课题组 诚招博士生 +5 NWPUGZG 2024-05-13 9/450 2024-05-13 16:40 by NWPUGZG
信息提示
请填处理意见